RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeastyeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRX1YBL064C ARK1P53974 638 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C STP1Q00947 519 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C ODC1Q03028 310 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C MMT1Q03218 510 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C RSN1Q03516 953 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C ATC1Q04005 294 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C URC2Q04411 772 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C AAD15Q08361 143 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C PEX27Q08580 376 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YOL107WQ12239 342 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C RMD5Q12508 421 aa3.87□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C TY4B-HP0C2J7 1802 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C TY4B-JP47024 1803 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C OPI3P05375 206 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C CDC37P06101 506 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YKL070WP36087 169 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C TCD1P38756 429 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C HAT2P39984 401 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C PCI8P40512 444 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C PMT5P52867 743 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C CGR1P53188 120 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YNR048WP53740 393 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YNL050CP53952 270 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C STD1Q02794 444 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C ECM7Q06200 448 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C ARR1Q06596 294 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C DSE3Q08729 430 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C SRL2Q12020 392 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YPR022CQ12139 1133 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YOR012WQ12351 137 aa3.86□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C ARG80P07249 177 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C RPL12BP0CX54 165 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C THR4P16120 514 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C SPO12P17123 173 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C SKN1P33336 771 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C ATP3P38077 311 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YBR056WP38081 501 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C END3P39013 349 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C MMF1P40185 145 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YIL152WP40455 235 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C INA22P40576 216 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C IKS1P47042 667 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YGL185CP53100 379 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YGL114WP53134 725 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C BET5Q03630 159 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C BCP1Q06338 283 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C GIS3Q12418 502 aa3.85□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C UGA1P17649 471 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C PTP1P25044 335 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YCR022CP25620 114 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C TIP1P27654 210 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C ASF2P32448 525 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C SUA5P32579 426 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C TRS65P32893 560 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.84□□□□□ -1.79not detected
PRX1YBL064C SPT10P35208 640 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C ASK1P35734 292 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C RPC37P36121 282 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YBR139WP38109 508 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C DIM1P41819 318 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C GCN20P43535 752 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C AVT4P50944 713 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C MND1P53102 219 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C POP6P53218 158 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YNL134CP53912 376 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C MPS1P54199 764 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C RPM2Q02773 1202 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C MRP51Q02950 344 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C DIG1Q03063 452 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C YLL007CQ07799 665 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C TIM18Q08749 192 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C MUM3Q08750 479 aa3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PRX1YBL064C TEF1P02994 458 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C PET18P25362 215 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C GLC7P32598 312 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C MGM101P32787 269 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C PTR2P32901 601 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C YKL097CP34245 136 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C SWC5P38326 303 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C SHO1P40073 367 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C YLR281CQ05863 155 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C STE23Q06010 1027 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C BOP2Q06150 570 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C YLR173WQ06247 608 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C YPR078CQ06813 372 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C GEP3Q08622 556 aa3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PRX1YBL064C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.3 ms