RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC37A4O43826 429 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF862O60290 1169 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 C22orf31O95567 290 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 NEK8Q86SG6 692 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 YME1L1Q96TA2 773 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 DLL1O00548 723 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 ENPP3O14638 875 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 JAK2O60674 1132 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 OATP04181 439 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 KRT2P35908 639 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 ERVK-21P61565 698 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 PRKCEQ02156 737 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 UGCGQ16739 394 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 METTL13Q8N6R0 699 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 RDM1Q8NG50 284 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 PRDM6Q9NQX0 595 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 GINS2Q9Y248 185 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 MTCH2Q9Y6C9 303 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 FOSBP53539 338 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 ST3GAL1Q11201 340 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 PAK2Q13177 524 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 GRB10Q13322 594 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 B3GNT9Q6UX72 402 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 PADI3Q9ULW8 664 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 UNC80Q8N2C7 3258 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGEB2O15479 319 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 NR5A1Q13285 461 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 KRT40Q6A162 431 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM20AQ96MK3 541 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 CDHR5Q9HBB8 845 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNMB3Q9NPA1 279 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM205CA6NFA0 338 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 LPXNO60711 386 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 MMP1P03956 469 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 VTNP04004 478 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 CLCN3P51790 818 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM29Q14134 588 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 KIZQ2M2Z5 673 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 TNFRSF25Q93038 417 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-211ENST00000493436 MARCH6O60337 910 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 RPS6KA5O75582 802 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 TMOD1P28289 359 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP7D2Q96T17 732 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF2CQ99661 725 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 AKT3Q9Y243 479 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 COL4A6Q14031 1691 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 BTBD18B2RXH4 712 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 EML1O00423 815 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 TBX3O15119 743 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR32O75388 356 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP2R5CQ13362 524 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 XKR3Q5GH77 459 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 ODR4Q5SWX8 454 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 POTEDQ86YR6 584 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 BANK1Q8NDB2 785 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 HAS1Q92839 578 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 SAMD11Q96NU1 681 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 OSMRQ99650 979 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 TMX1Q9H3N1 280 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 THEGQ9P2T0 379 aa18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms