RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PFA4	YOL003C	CPR2	P23285	205 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	RRN10	P38204	145 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	IRC4	Q03036	179 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	HER2	Q03557	464 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SPO12	P17123	173 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	ANP1	P32629	500 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SPL2	P38839	148 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	NCA3	P46955	337 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	MTM1	P53320	366 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SRL2	Q12020	392 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	COX3	P00420	269 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	REV1	P12689	985 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	DBF4	P32325	704 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	YFH7	P43591	353 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	OCA2	P53949	197 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	URH1	Q04179	340 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SMA2	Q04658	369 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	HKR1	P41809	1802 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SPO7	P18410	259 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	MYO3	P36006	1272 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	RXT2	P38255	430 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	ZIM17	P42844	174 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	AZR1	P50080	613 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	PHB2	P50085	310 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	ATG34	Q12292	412 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	ISA2	Q12425	185 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	MTR10	Q99189	972 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	FIG2	P25653	1609 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	TRP1	P00912	224 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	MAK31	P23059	88 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RAD57	P25301	460 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	MSG5	P38590	489 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SER3	P40054	469 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	VHS2	P40463	436 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	YPS6	P40583	537 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	UBX2	Q04228	584 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	AIM32	Q04689	311 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CYC3	P06182	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
PFA4	YOL003C	KAR9	P32526	644 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SWD3	P38123	315 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	PFF1	P38244	976 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	JLP2	P40206	208 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SHE10	P53075	577 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	BCH1	Q05029	724 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	FDH1	Q08911	376 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	HRT3	Q12347	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	FLO1	P32768	1537 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CLN3	P13365	580 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	PET123	P17558	318 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	DAL2	P25335	343 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	LDB16	P25587	256 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	YEL045C	P32616	141 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SPT8	P38915	602 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	PAN6	P40459	309 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SFH5	P47008	294 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	YML6	P51998	286 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	ERO1	Q03103	563 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	VPS54	Q12071	889 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CEX1	Q12453	761 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	MYO1	P08964	1928 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	GSC2	P40989	1895 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	ALG1	P16661	449 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	MNS1	P32906	549 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	PCH2	P38126	564 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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