RNA–Protein interactions for RNA: YJL177W

RPL17B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L17B, yeastyeast

Gene RPL17B, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BYJL177W OPY1P38271 328 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W YHR054CP38780 354 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W STN1P38960 494 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W MST28P39552 234 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W OST1P41543 476 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W SSU1P41930 458 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W SPG5P42933 373 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W COS5P47187 383 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W SSN8P47821 323 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W YGL242CP53066 181 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W YGL138CP53122 345 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W VPS9P54787 451 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W ERV25P54837 211 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W HOT1Q03213 719 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W VPS20Q04272 221 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W NNT1Q05874 261 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W COS7Q07788 383 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W ESA1Q08649 445 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W TIM18Q08749 192 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W YOR387CQ08910 206 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W YPR022CQ12139 1133 aa2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W MHP1P43638 1398 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W CPR4P25334 318 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W RPC53P25441 422 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W SIN4P32259 974 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W SMI1P32566 505 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W MDL1P33310 695 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.78□□□□□ -1.96not detected
RPL17BYJL177W YUH1P35127 236 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W SWH1P35845 1188 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W RIB5P38145 238 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W RFC3P38629 340 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W NDT80P38830 627 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.78□□□□□ -1.96not detected
RPL17BYJL177W MTW1P39731 289 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W INA22P40576 216 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W RET3P53600 189 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W FRE4P53746 719 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W YDR131CQ03899 556 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W PBA1Q05778 276 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W LOT6Q07923 191 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W VAM3Q12241 283 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W YLR108CQ12259 485 aa2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RPL17BYJL177W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W SWI1P09547 1314 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W HHF1P02309 103 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W MSS116P15424 664 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W PDX1P16451 410 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W MNE1P24720 663 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W SNT1P25357 1226 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W RHB1P25378 209 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W SPS22P25380 463 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W KRE2P27809 442 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W NAM9P27929 486 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W BEM1P29366 551 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W SRB4P32569 687 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W SDH3P33421 198 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W STB6P36085 766 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W PEX32P38292 413 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W SEC28P40509 296 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W LIA1P47120 325 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W YGR266WP53326 701 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W SKO1Q02100 647 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W KAP120Q02932 1032 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W PEX25Q02969 394 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W ROY1Q04847 553 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W DON1Q05610 365 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W MDM30Q05930 598 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W REX4Q08237 289 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W ERV2Q12284 196 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W ISA2Q12425 185 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W AHC1Q12433 566 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W RAD61Q99359 647 aa2.77□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W ADK2P26364 225 aa2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W MEI5P32489 222 aa2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W DOA4P32571 926 aa2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W BUD2P33314 1104 aa2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W GDI1P39958 451 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W HMS2P47175 358 aa2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W MLC1P53141 149 aa2.76□□□□□ -1.97
RPL17BYJL177W YNR048WP53740 393 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.4 ms