RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W CDC42P19073 191 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MEI5P32489 222 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MRS6P32864 603 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W PPQ1P32945 549 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W LEU5P38702 357 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W EGD2P38879 174 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W FLC2P39719 783 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YAT2P40017 923 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RTT102P53330 157 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YNL146WP53906 100 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GAL83Q04739 417 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ARV1Q06541 321 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W AAD15Q08361 143 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YNG1Q08465 219 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W FEX2Q08991 375 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W AVL9Q12500 764 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YOS9Q99220 542 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W BI3Q9ZZW7 517 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YML003WP0CF16 290 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RFA2P26754 273 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ECM13P38195 257 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TIR3P40552 269 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SMK1P41808 388 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W COS4P43542 379 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W FAR3P46671 204 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W LSM1P47017 172 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RPS12P48589 143 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ARO8P53090 500 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W COS1P53822 381 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SCS7Q03529 384 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ATG16Q03818 150 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CDD1Q06549 142 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W APC9Q12107 265 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YOR214CQ12282 236 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RGT2Q12300 763 aa3.69□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W STE3P06783 470 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ATG22P25568 528 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TMT1P32643 299 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CPR5P35176 225 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W AGP2P38090 596 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ARN1P38731 627 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W VMA13P41807 478 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GAT1P43574 510 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W HOC1P47124 396 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W OKP1P53298 406 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GOR1P53839 350 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YDR249CQ03787 373 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YMR321CQ04898 105 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W STP3Q05937 343 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SPH1Q06160 661 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YLR352WQ06479 807 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YET3Q07451 203 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YEH1Q07804 573 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W IES4Q08561 116 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YDR061WQ12298 539 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ATP14Q12349 124 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa3.68□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TRX1P22217 103 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CIN8P27895 1000 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SBE22P38814 852 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W AIM2P39721 246 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RTS2P40962 232 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TPN1P53099 579 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YPR003CP53394 754 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YMR279CQ03263 540 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YDR018CQ12185 396 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W COX17Q12287 69 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ERP3Q12403 225 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TPK3P05986 398 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TPK1P06244 397 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GPH1P06738 902 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SNF1P06782 633 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W PMS1P14242 873 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W FBA1P14540 359 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MER1P16523 270 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TKL1P23254 680 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CNB1P25296 175 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ITR1P30605 584 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SPT14P32363 452 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W FUI1P38196 639 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RTT105P40063 208 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SOK1P40317 901 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YKE4P40544 346 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W AGP3P43548 558 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W PHO86P46956 311 aa3.67□□□□□ -1.82
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