RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 HIPK3Q9H422 1215 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 SLC9A2Q9UBY0 812 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 CTDNEP1O95476 244 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 THPOP40225 353 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 GJA9P57773 515 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 SP2Q02086 613 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 NEK8Q86SG6 692 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 RNF169Q8NCN4 708 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 SEPT1Q8WYJ6 367 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 PLIN2Q99541 437 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 ADAMTS4O75173 837 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 UPP2O95045 317 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 MMP3P08254 477 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 CLTBP09497 229 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGAP1Q07960 439 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 PPFIA1Q13136 1202 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 PTGISQ16647 500 aa5.6□□□□□ -1.51
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CLVS1-205ENST00000519846 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 ZBED2Q9BTP6 218 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 TEKT3Q9BXF9 490 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.6□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 HTTP42858 3142 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 LOC285556D6RIA3 1793 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 FAM86B1E9PN63 330 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 ARVCFO00192 962 aa5.59□□□□□ -1.51
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CLVS1-205ENST00000519846 FAM86B2P0C5J1 330 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 MCM2P49736 904 aa5.59□□□□□ -1.51
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CLVS1-205ENST00000519846 ACTR2P61160 394 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 MTERF2Q49AM1 385 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 FAM173BQ6P4H8 233 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 METTL7BQ6UX53 244 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 TPH2Q8IWU9 490 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 ZHX3Q9H4I2 956 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 JADE2Q9NQC1 790 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 MYO7AQ13402 2215 aa5.59□□□□□ -1.51
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CLVS1-205ENST00000519846 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 DESI1Q6ICB0 168 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 COL26A1Q96A83 441 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 GPRASP2Q96D09 838 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 AGXT2Q9BYV1 514 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 OCEL1Q9H607 264 aa5.59□□□□□ -1.51
CLVS1-205ENST00000519846 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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CLVS1-205ENST00000519846 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
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CLVS1-205ENST00000519846 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 CSF2RAP15509 400 aa5.59□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 SEMA3FQ13275 785 aa5.59□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 BECN1Q14457 450 aa5.59□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.59□□□□□ -1.52
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CLVS1-205ENST00000519846 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
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CLVS1-205ENST00000519846 M0QZ92 97 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLVS1-205ENST00000519846 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLVS1-205ENST00000519846 SREBF1P36956 1147 aa5.58□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.58□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.58□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 KIF2CQ99661 725 aa5.58□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 PANK2Q9BZ23 570 aa5.58□□□□□ -1.52
CLVS1-205ENST00000519846 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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