RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	MRX4	Q12467	430 aa		5.3	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	PSF1	Q12488	208 aa		5.3	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	MRP10	O75012	95 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	REV1	P12689	985 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.29	□□□□□ -1.56	not detected
VBA1	YMR088C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	TRK2	P28584	889 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SCM4	P32564	187 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	MCH2	P36032	473 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YKL070W	P36087	169 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	DTR1	P38125	572 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YBR220C	P38318	560 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	POP4	P38336	279 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	UIP3	P39547	235 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	LSB6	P42951	607 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	NIT2	P47016	307 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YJR030C	P47101	745 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	BIO3	P50277	480 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	PMT5	P52867	743 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YCL001W-A	P87012	153 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	AAT1	Q01802	451 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	CSM3	Q04659	317 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YDL086W	Q07505	273 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YDR061W	Q12298	539 aa		5.29	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	CDC7	P06243	507 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SGF29	P25554	259 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	PBN1	P25580	416 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	RAD14	P28519	371 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SPR1	P32603	445 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SLC1	P33333	303 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	UPS2	P35200	230 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	TFA2	P36145	328 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	TVP38	P36164	337 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SFB3	P38810	929 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	ALY2	P47029	1046 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YJR149W	P47177	404 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SOL1	P50278	321 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	DSD1	P53095	428 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YGR026W	P53217	278 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	ERG5	P54781	538 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	ADI1	Q03677	179 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	RIM13	Q03792	727 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	RAD34	Q06665	692 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	COS7	Q07788	383 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	CRT10	Q08226	957 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	ELG1	Q12050	791 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	PDR12	Q02785	1511 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	IMA3	P0CW40	589 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	IMA4	P0CW41	589 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	HEM15	P16622	393 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	MRPL44	P19956	98 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	ZRC1	P20107	442 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YSP3	P25036	478 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SEC65	P29478	273 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	AFG1	P32317	509 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	ETR1	P38071	380 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	HSL7	P38274	827 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	RRT2	P38332	387 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	GIC1	P38785	314 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	AFG3	P39925	761 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	JHD1	P40034	492 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	PIC2	P40035	300 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	PFD1	P46988	109 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	DIE2	P50076	525 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	ALT2	P52892	507 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	ERV14	P53173	138 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YNR065C	P53751	1116 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YMR210W	Q03649	449 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	GIS4	Q04233	774 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	PEX30	Q06169	523 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	CUR1	Q06469	252 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	RTT109	Q07794	436 aa		5.28	□□□□□ -1.56
VBA1	YMR088C	YLR036C	Q07986	203 aa		5.28	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.7 ms