RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	CAC2	Q04199	468 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RCO1	Q04779	684 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GAD1	Q04792	585 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	OPT2	Q06593	877 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	FMP25	Q08023	583 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YDR018C	Q12185	396 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	REC8	Q12188	680 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	FLO1	P32768	1537 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	HTB2	P02294	131 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SPT3	P06844	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PHO80	P20052	293 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	DCC1	P25559	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CDC20	P26309	610 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RPD3	P32561	433 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MBA1	P38300	278 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SHG1	P38337	142 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PAN5	P38787	379 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PRM9	P39551	298 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PKP1	P40530	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CFD1	P40558	293 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	AAD14	P42884	376 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YFL040W	P43562	540 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	UFD1	P53044	361 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MTC3	P53077	123 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	VOA1	P53262	265 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YGR168C	P53293	376 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	TRM12	Q04235	462 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	HOF1	Q05080	669 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GAL80	P04387	435 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SPS2	P08459	502 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	URA6	P15700	204 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
SKG6	YHR149C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MRPL9	P31334	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
SKG6	YHR149C	SOL2	P37262	315 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YHR054C	P38780	354 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	FLC2	P39719	783 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YIL024C	P40543	189 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	FIG4	P42837	879 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SLS1	P42900	643 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GUP1	P53154	560 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SPR6	Q01684	191 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	TMA10	Q06177	86 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	HDA2	Q06629	674 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	LCB4	Q12246	624 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RGS2	Q99188	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MTR10	Q99189	972 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RHO2	P06781	192 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MET8	P15807	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SEC62	P21825	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	DAL2	P25335	343 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
SKG6	YHR149C	ACB1	P31787	87 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SHP1	P34223	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	TUL1	P36096	758 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	ACO2	P39533	789 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MRX5	P47007	382 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YJR056C	P47115	236 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CLA4	P48562	842 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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