RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W LCB3P47013 409 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W AIM24P47127 394 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YGL108CP53139 140 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W VHT1P53241 593 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W DSL1P53847 754 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W TDA1Q03533 586 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SGT1Q08446 395 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W VPS54Q12071 889 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W HIS4P00815 799 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SPO12P17123 173 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W PRD1P25375 712 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MIG1P27705 504 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ZIP1P31111 875 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W DBF4P32325 704 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W DBF20P32328 564 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MED6P38782 295 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RRP4P38792 359 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W COX14P39103 70 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W PEX22P39718 180 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W HMS2P47175 358 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W PHB2P50085 310 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SEH1P53011 349 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W VEL1P53058 206 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YGL088WP53151 121 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W CLD1P53264 445 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W HSP31Q04432 237 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MRX8Q05473 314 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W CDD1Q06549 142 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W DDC1Q08949 612 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YPT6Q99260 215 aa-0.07□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W PRE8P23639 250 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W TFB1P32776 642 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W COX13P32799 129 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W WBP1P33767 430 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W DBP7P36120 742 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ECM34P38728 170 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W DPH1P40487 425 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SAS2P40963 338 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W OAZ1Q02803 292 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W NGL3Q03210 505 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W FIN1Q03898 291 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W IOC4Q04213 475 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W TAP42Q04372 366 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MDM36Q06820 579 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YEH1Q07804 573 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SMC5Q08204 1093 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YOR376WQ08900 122 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RIM20Q12033 661 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa-0.08□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YLR278CQ05854 1341 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W GAL80P04387 435 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W CDC16P09798 840 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W CTR86P25355 563 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YCL068CP25593 260 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W GYP6P32806 458 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SLC1P33333 303 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W NIP100P33420 868 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SKT5P34226 696 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W WSC4P38739 605 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RRT13P40042 185 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W PCL7P40186 285 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MAM33P40513 266 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W COS1P53822 381 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W CCE1Q03702 353 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YDR115WQ04598 105 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YLR345WQ06137 509 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RAX1Q08760 435 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SRL2Q12020 392 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MCT1Q12283 360 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SKM1Q12469 655 aa-0.09□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ATP4P05626 244 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W RHO2P06781 192 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W ASP3-2P0CX77 362 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W ASP3-3P0CX78 362 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W ASP3-4P0CX79 362 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W ASP3-1P0CZ17 362 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W SSB1P11484 613 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W SEC63P14906 663 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W CLN1P20437 546 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W EPT1P22140 391 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W IDH2P28241 369 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W AFG1P32317 509 aa-0.1□□□□□ -2.43
RDS3YPR094W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
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