RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	MEI4	P29467	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	RPC34	P32910	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YPK3	P38070	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	DUG2	P38149	878 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	MMS21	P38632	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	GAB1	P41733	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YJL163C	P46996	555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YGL159W	P53110	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	RRN9	P53437	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	RNT1	Q02555	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	SSY1	Q03770	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YFT2	Q06676	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	SWM1	Q12379	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	TRM2	P33753	639 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	AST1	P35183	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	AME1	P38313	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YHR122W	P38829	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	MTL1	P53214	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YGR127W	P53275	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	IZH1	Q03419	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	SPO77	Q06134	477 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	NSE1	Q07913	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	FRE5	Q08908	694 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	BAG7	Q12128	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SPS4	P09937	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ECM25	P32525	599 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RTC2	P38279	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RPP1	P38786	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	FMO1	P38866	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RSM25	P40496	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SPG5	P42933	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CHA4	P43634	648 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	PLB2	Q03674	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CYK3	Q07533	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YEH2	Q07950	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	REV1	P12689	985 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	STE18	P18852	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RRT12	P25381	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YER121W	P40076	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	FAR3	P46671	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	FAR8	Q05040	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MDM30	Q05930	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SYO1	Q07395	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	PEX27	Q08580	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ESA1	Q08649	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	RAD1	P06777	1100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SIN4	P32259	974 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	TAF14	P35189	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	GMH1	P36125	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	QDR3	P38227	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MIC12	P38341	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	UBA4	P38820	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SPC97	P38863	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ELO1	P39540	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ERG28	P40030	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	AMA1	P50082	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YGL108C	P53139	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	UBP16	Q02863	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ARO10	Q06408	635 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MSH5	Q12175	901 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	CDC6	P09119	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	LIP5	P32875	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	FES1	P38260	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	DSE1	P40077	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	OPT1	P40897	799 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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