RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 NXPE1Q8N323 547 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 NETO1Q8TDF5 533 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ZEB2O60315 1214 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRN2O75325 713 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PRKD3O94806 890 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ABLIM3O94929 683 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PRNPP04156 253 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 FLT3P36888 993 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ECI1P42126 302 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 MLC1Q15049 377 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 USP53Q70EK8 1073 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 MFSD4AQ8N468 514 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 FIBCD1Q8N539 461 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 WNK4Q96J92 1243 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC140Q96MF4 163 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ORAI3Q9BRQ5 295 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 METP08581 1390 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 E2F8A0AVK6 867 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PYGMP11217 842 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ETV3P41162 512 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF4P78317 190 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 TNK2Q07912 1038 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 BNIP3Q12983 259 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 GRB10Q13322 594 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 NXNQ6DKJ4 435 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 STYK1Q6J9G0 422 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXL18Q96ME1 805 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ARNTLO00327 626 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PLIN1O60240 522 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPY4P0CV99 314 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPY10P0CW01 314 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SCNN1BP51168 640 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SPRED2Q7Z698 418 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF141Q8WVD5 230 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 VTA1Q9NP79 307 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 BTG4Q9NY30 223 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 B4E1Z4 1266 aa7.22□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CBX4O00257 560 aa7.22□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 RFPL1O75677 317 aa7.22□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 TOMM70O94826 608 aa7.22□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXO21O94952 628 aa7.22□□□□□ -1.25
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