Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXC2

GFOD1, Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFOD1Q9NXC2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GFOD1Q9NXC2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GFOD1Q9NXC2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GFOD1Q9NXC2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GFOD1Q9NXC2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GFOD1Q9NXC2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GFOD1Q9NXC2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GFOD1Q9NXC2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GFOD1Q9NXC2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GFOD1Q9NXC2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GFOD1Q9NXC2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GFOD1Q9NXC2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GFOD1Q9NXC2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GFOD1Q9NXC2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GFOD1Q9NXC2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GFOD1Q9NXC2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GFOD1Q9NXC2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFOD1Q9NXC2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GFOD1Q9NXC2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GFOD1Q9NXC2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFOD1Q9NXC2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFOD1Q9NXC2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GFOD1Q9NXC2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GFOD1Q9NXC2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFOD1Q9NXC2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFOD1Q9NXC2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GFOD1Q9NXC2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFOD1Q9NXC2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GFOD1Q9NXC2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GFOD1Q9NXC2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GFOD1Q9NXC2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFOD1Q9NXC2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFOD1Q9NXC2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GFOD1Q9NXC2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFOD1Q9NXC2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFOD1Q9NXC2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFOD1Q9NXC2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFOD1Q9NXC2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFOD1Q9NXC2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFOD1Q9NXC2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GFOD1Q9NXC2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFOD1Q9NXC2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFOD1Q9NXC2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFOD1Q9NXC2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFOD1Q9NXC2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GFOD1Q9NXC2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFOD1Q9NXC2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFOD1Q9NXC2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFOD1Q9NXC2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GFOD1Q9NXC2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFOD1Q9NXC2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFOD1Q9NXC2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFOD1Q9NXC2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFOD1Q9NXC2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFOD1Q9NXC2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFOD1Q9NXC2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFOD1Q9NXC2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFOD1Q9NXC2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFOD1Q9NXC2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFOD1Q9NXC2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFOD1Q9NXC2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFOD1Q9NXC2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFOD1Q9NXC2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFOD1Q9NXC2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFOD1Q9NXC2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFOD1Q9NXC2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFOD1Q9NXC2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFOD1Q9NXC2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFOD1Q9NXC2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFOD1Q9NXC2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFOD1Q9NXC2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFOD1Q9NXC2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFOD1Q9NXC2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFOD1Q9NXC2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFOD1Q9NXC2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFOD1Q9NXC2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GFOD1Q9NXC2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFOD1Q9NXC2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GFOD1Q9NXC2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GFOD1Q9NXC2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFOD1Q9NXC2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFOD1Q9NXC2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFOD1Q9NXC2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFOD1Q9NXC2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFOD1Q9NXC2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFOD1Q9NXC2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFOD1Q9NXC2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFOD1Q9NXC2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFOD1Q9NXC2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFOD1Q9NXC2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFOD1Q9NXC2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GFOD1Q9NXC2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFOD1Q9NXC2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFOD1Q9NXC2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFOD1Q9NXC2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFOD1Q9NXC2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFOD1Q9NXC2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GFOD1Q9NXC2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GFOD1Q9NXC2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFOD1Q9NXC2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms