RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402613.3

VSTM2A-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VSTM2A, Length 1,076 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-202ENST00000402613 GPNMBQ14956 572 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 NIPA1Q7RTP0 329 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 ATP6V0A1Q93050 837 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 NFASCO94856 1347 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM86B1E9PN63 330 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 DEXIO95424 95 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM86B2P0C5J1 330 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 GUCD1Q96NT3 240 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 SDF4Q9BRK5 362 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 SETD4Q9NVD3 440 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 TREHO43280 583 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 PARNO95453 639 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 GNAT1P11488 350 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 ACTN1P12814 892 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 PBX2P40425 430 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 SCRN1Q12765 414 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 PBX4Q9BYU1 374 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
VSTM2A-202ENST00000402613 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ZBBXA8MT70 800 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 AK2P54819 239 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 NLRP5P59047 1200 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKRD1Q15327 319 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF618Q5T7W0 954 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 TRAF7Q6Q0C0 670 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 PLA2G4DQ86XP0 818 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 GLG1Q92896 1179 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 TIFAQ96CG3 184 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ERAP1Q9NZ08 941 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 DOCK5Q9H7D0 1870 aa27.06■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 PFKFB2O60825 505 aa27.06■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ADAM17P78536 824 aa27.06■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 PCYT2Q99447 389 aa27.06■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 NRCAMQ92823 1304 aa27.06■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 NBNO60934 754 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 LGR5O75473 907 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 CXCL10P02778 98 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 MARK3P27448 753 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 THPOP40225 353 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ACTR2P61160 394 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 LMBR1Q8WVP7 490 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 AIFM3Q96NN9 605 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 EMSYQ7Z589 1322 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 CDKL5O76039 1030 aa27.04■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 CIITAP33076 1130 aa27.04■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 PCDHA4Q9UN74 947 aa27.04■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ATG7O95352 703 aa27.03■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 MBTPS1Q14703 1052 aa27.03■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 RAB30Q15771 203 aa27.03■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 AZI2Q9H6S1 392 aa27.03■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 MSRAQ9UJ68 235 aa27.03■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 SCN5AQ14524 2016 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 RSPH10B2B2RC85 870 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 DHX15O43143 795 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 EDIL3O43854 480 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 BAIAP3O94812 1187 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 RSPH10BP0C881 870 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 SETQ01105 290 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 PPFIA1Q13136 1202 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF577Q9BSK1 485 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF576Q9H609 170 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 TANC1Q9C0D5 1861 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM2A-202ENST00000402613 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 CAND2O75155 1236 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 CCNE2O96020 404 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 NEK4P51957 841 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 RABGGTBP53611 331 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 PRR16Q569H4 304 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 CNKSR3Q6P9H4 555 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 BLIDQ8IZY5 108 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 UIMC1Q96RL1 719 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 COL6A3P12111 3177 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 M0R2N6 131 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 CTDNEP1O95476 244 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 STAT5BP51692 787 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 USP11P51784 963 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 NPY5RQ15761 445 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 GRIK4Q16099 956 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 ME3Q16798 604 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 GALNT17Q6IS24 598 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 DAGLBQ8NCG7 672 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa27■■□□□ 1.91
VSTM2A-202ENST00000402613 TBC1D22BQ9NU19 505 aa27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms