RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 LAMA3Q16787 3333 aa28.96■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 PTK7Q13308 1070 aa28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 PRR16Q569H4 304 aa28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 GALNT17Q6IS24 598 aa28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 KCNJ14Q9UNX9 436 aa28.95■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 CTDNEP1O95476 244 aa28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 IQCF3P0C7M6 154 aa28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 GNAT1P11488 350 aa28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 MARK3P27448 753 aa28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 AZI2Q9H6S1 392 aa28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.94■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 RFC2P35250 354 aa28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 ACTR2P61160 394 aa28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 HIC1Q14526 733 aa28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 DAGLBQ8NCG7 672 aa28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 SETD4Q9NVD3 440 aa28.93■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 GPR153Q6NV75 609 aa28.92■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 TBCKQ8TEA7 893 aa28.92■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa28.92■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.92■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 PFKMP08237 780 aa28.91■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 CKBP12277 381 aa28.91■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 SELPP16109 830 aa28.91■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 USP11P51784 963 aa28.91■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.91■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 PHF20Q9BVI0 1012 aa28.91■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 TREHO43280 583 aa28.9■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 CIITAP33076 1130 aa28.9■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 DEFB123Q8N688 67 aa28.9■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 HERVK_113Q902F9 699 aa28.9■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 EMSYQ7Z589 1322 aa28.9■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 SZT2Q5T011 3432 aa28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 ZBBXA8MT70 800 aa28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 ACTN1P12814 892 aa28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 THPOP40225 353 aa28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 KRT25Q7Z3Z0 450 aa28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 SERINC5Q86VE9 423 aa28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D22BQ9NU19 505 aa28.89■■■□□ 2.22
CTXN1-201ENST00000318978 NRCAMQ92823 1304 aa28.89■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 M0R2N6 131 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 BACH1O14867 736 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 LGR5O75473 907 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 PPFIA1Q13136 1202 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 NPY5RQ15761 445 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 Q7L0L9 218 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 WNT8BQ93098 351 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 KIF2CQ99661 725 aa28.88■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 HOXC8P31273 242 aa28.87■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 STAT5BP51692 787 aa28.87■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 FOSBP53539 338 aa28.87■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 RBL2Q08999 1139 aa28.87■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.87■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 PCYT2Q99447 389 aa28.87■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 TRPC6Q9Y210 931 aa28.87■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 JAK2O60674 1132 aa28.86■■■□□ 2.21
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CTXN1-201ENST00000318978 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 IGBP1P78318 339 aa28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 TRIM29Q14134 588 aa28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 RASIP1Q5U651 963 aa28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 FAM160B1Q5W0V3 765 aa28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC83Q8IWF9 413 aa28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 BRMS1Q9HCU9 246 aa28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 DHX15O43143 795 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 ATG7O95352 703 aa28.85■■■□□ 2.21
CTXN1-201ENST00000318978 GRIK4Q16099 956 aa28.85■■■□□ 2.21
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