RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PFA4	YOL003C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	YJL132W	P47014	750 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	SFI1	Q12369	946 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	NFU1	P32860	256 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	FRE2	P36033	711 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	CBP4	P37267	147 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	VTC2	P43585	828 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	BOR1	P53838	576 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	TLG2	Q08144	397 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	PMR1	P13586	950 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	YIM1	P28625	365 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	RSM22	P36056	628 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	RRT5	P43607	289 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	TRS85	P46944	698 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
PFA4	YOL003C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	PPH22	P23595	377 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	SNT1	P25357	1226 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	MSP1	P28737	362 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	NDI1	P32340	513 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	NIP100	P33420	868 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	SAS3	P34218	831 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	AVT4	P50944	713 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	WSC2	P53832	503 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	SCW10	Q04951	389 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	HNT3	Q08702	217 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	SWI1	P09547	1314 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	HIP1	P06775	603 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	RIP1	P08067	215 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	CLB3	P24870	427 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	REC114	P32841	428 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YBP1	P38315	674 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	PCA1	P38360	1216 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	PNG1	Q02890	363 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	ODC1	Q03028	310 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	PIR3	Q03180	325 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	RMT2	Q03305	412 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	NCB2	Q92317	146 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YCR100C	P25606	316 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	RML2	P32611	393 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	CAF40	P53829	373 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	CBS2	P14905	389 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	SEC63	P14906	663 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	HCS1	P34243	683 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	AVT5	P38176	459 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	VPS20	Q04272	221 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	HSP31	Q04432	237 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	PDR18	P53756	1333 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	RIM15	P43565	1770 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	FMS1	P50264	508 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	POP6	P53218	158 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	SIL1	Q08199	421 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	ECM25	P32525	599 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	MRP4	P32902	394 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YCR041W	P37265	110 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	VHC1	P38329	1120 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	RFC3	P38629	340 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	YGL242C	P53066	181 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	MLC1	P53141	149 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	DSL1	P53847	754 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	ISN1	Q99312	450 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	CHS1	P08004	1131 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	BYE1	P36106	594 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PFA4	YOL003C	PIM1	P36775	1133 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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