RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	GEX1	P25596	615 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	DBF4	P32325	704 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SDH3	P33421	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SOR2	Q07786	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	MED2	Q12124	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	CLB1	P24868	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	BRF1	P29056	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	FAA2	P39518	744 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	TAF12	Q03761	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	ORT1	Q12375	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SPO7	P18410	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	CLN1	P20437	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	CTR86	P25355	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	YOX1	P34161	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	KKQ8	P36004	724 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	MTC6	P38849	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	NCA3	P46955	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	TOF1	P53840	1238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	HOT1	Q03213	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	RSN1	Q03516	953 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	BET5	Q03630	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	ACL4	Q03771	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	DCS1	Q06151	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	ISA2	Q12425	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SLY1	P22213	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	NAM9	P27929	486 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	ITR1	P30605	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	RRN10	P38204	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	YGR210C	P42942	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	BTN2	P53286	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	GPI15	P53961	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	PPM1	Q04081	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	RMD5	Q12508	421 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SWH1	P35845	1188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	SLM4	P38247	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	RRT2	P38332	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	YAL037W	P39728	267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	PRM5	P40476	318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	PHO86	P46956	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	HXT11	P54862	567 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	HER2	Q03557	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	ERV1	P27882	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	REE1	P40893	198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	MDG1	P53885	366 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	MMR1	Q06324	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	CPR2	P23285	205 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	SDS24	P38314	527 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	OCA2	P53949	197 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	SMA2	Q04658	369 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	BUG1	Q12191	341 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	REV1	P12689	985 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	ZIM17	P42844	174 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	TCB2	P48231	1178 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	PHB2	P50085	310 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	AIM32	Q04689	311 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	VPS54	Q12071	889 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	TMS1	Q12116	473 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	MTR10	Q99189	972 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	HOM3	P10869	527 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	YBR137W	P38276	179 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	TOM22	P49334	152 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	AZR1	P50080	613 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	TRP1	P00912	224 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	SPO12	P17123	173 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.48	□□□□□ -1.69	not detected
SPC24	YMR117C	PET123	P17558	318 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	DAL2	P25335	343 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	SRL2	Q12020	392 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	ATG34	Q12292	412 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SPC24	YMR117C	RAD57	P25301	460 aa		4.46	□□□□□ -1.7

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