RNA–Protein interactions for RNA: YKR077W

MSA2, Transcript of Putative transcriptional activator, yeast

Gene MSA2, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSA2	YKR077W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	SNT1	P25357	1226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	YCR051W	P25631	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	YME2	P32843	850 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	NAT2	P37293	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	YHR054C	P38780	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	YFL067W	P43537	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	ECM27	P47144	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	SSN8	P47821	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	MUM3	Q08750	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	HSP42	Q12329	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	CHS1	P08004	1131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	SEC63	P14906	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	HEM15	P16622	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	SIN4	P32259	974 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	SAS2	P40963	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	COS5	P47187	383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	YGL138C	P53122	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	IBD2	P53892	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	COS7	Q07788	383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	VAM3	Q12241	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	ISN1	Q99312	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSA2	YKR077W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	KRE2	P27809	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	ROY1	Q04847	553 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	BEM1	P29366	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	STB6	P36085	766 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	PIM1	P36775	1133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RFC3	P38629	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YPI1	P43587	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	DON1	Q05610	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RPC53	P25441	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	ADK2	P26364	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	HIR2	P32480	875 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	MST28	P39552	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	SKO1	Q02100	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	MDM30	Q05930	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	ESA1	Q08649	445 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	TIM18	Q08749	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RSA1	Q08932	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	AFI1	Q99222	893 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	PDX1	P16451	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RHB1	P25378	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	MIX23	P38162	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YIL067C	P40514	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	LAM5	P43560	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	GOR1	P53839	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RRN11	Q04712	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	SGT1	Q08446	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	SPS22	P25380	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
MSA2	YKR077W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	FRE4	P53746	719 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	REX4	Q08237	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RAD61	Q99359	647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	GEX1	P25596	615 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	TFB1	P32776	642 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YBL059W	P34224	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YBR139W	P38109	508 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	RIB5	P38145	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	SPG5	P42933	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	HMS2	P47175	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YGL242C	P53066	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YNR048W	P53740	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	PBA1	Q05778	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSA2	YKR077W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	SCEI	P03882	235 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	URA4	P20051	364 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	CPR4	P25334	318 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	MMS4	P38257	691 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	NDT80	P38830	627 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	RMT2	Q03305	412 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	ERV2	Q12284	196 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	LSB5	P25369	354 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	ITR1	P30605	584 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSA2	YKR077W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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