RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MEP1	P40260	492 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PAN6	P40459	309 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	AIM23	P47015	356 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GLO1	P50107	326 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	UBC11	P52492	156 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	IMA1	P53051	589 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	SHY1	P53266	389 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	SEG1	Q04279	960 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	RCO1	Q04779	684 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	SPC2	Q04969	178 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GLO2	Q05584	274 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GGA1	Q06336	557 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	UAF30	Q08747	228 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	SEC39	Q12745	709 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	HIP1	P06775	603 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	COS2	P0CX12	379 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	COS3	P0CX13	379 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	RSR1	P13856	272 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YAK1	P14680	807 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	URA4	P20051	364 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PHO3	P24031	467 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	CLB3	P24870	427 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MEF1	P25039	761 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PHO91	P27514	894 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	URK1	P27515	501 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YBL029W	P38201	376 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	HPM1	P40481	377 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	BAP3	P41815	604 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	COS4	P43542	379 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MPS3	P47069	682 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YJR154W	P47181	346 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MTL1	P53214	551 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PRM1	P53835	661 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	ARP4	P80428	489 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PIR1	Q03178	341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PPN1	Q04119	674 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	HSP31	Q04432	237 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GAD1	Q04792	585 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	RIF2	Q06208	395 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PSR1	Q07800	427 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YEH2	Q07950	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	SGO1	Q08490	590 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MUM3	Q08750	479 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	HUA2	Q12134	243 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GTT2	Q12390	233 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	AHC1	Q12433	566 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	ATP6	P00854	259 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MSS18	P08593	268 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	CCA1	P21269	546 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MRPS28	P21771	286 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	SWE1	P32944	819 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	CSE1	P33307	960 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	TIP20	P33891	701 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PXA2	P34230	853 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	AST1	P35183	429 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	ALY1	P36117	915 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	TDP1	P38319	544 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YHR112C	P38716	378 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	RPH1	P39956	796 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	HEM14	P40012	539 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MET18	P40469	1032 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MOB1	P40484	314 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	IMA5	P40884	581 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MNT2	P53059	558 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GET1	P53192	235 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GPI1	P53306	609 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MMT1	Q03218	510 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GAS3	Q03655	524 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	CIA1	Q05583	330 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	GMC2	Q06201	188 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	ASA1	Q06822	443 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
LAS1	YKR063C	BUD7	Q08754	746 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	MDM12	Q92328	271 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAS1	YKR063C	SFP1	P32432	683 aa		4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.4 ms