RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	MSN2	P33748	704 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	SHP1	P34223	423 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	DUG2	P38149	878 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	VID27	P40157	782 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YFH7	P43591	353 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	AIM22	P47051	409 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YGR117C	P53270	476 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YMR018W	Q04364	514 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	INM2	Q05533	292 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	RRI2	Q12348	645 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	RKM5	Q12367	367 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	PDR18	P53756	1333 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	CDC16	P09798	840 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	NAM9	P27929	486 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	BNA4	P38169	460 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YIL089W	P40500	205 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	GPI1	P53306	609 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	TOF2	Q02208	771 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	CHS1	P08004	1131 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	DPB3	P27344	201 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	SSH4	P32343	579 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	MCM10	P32354	571 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YEL045C	P32616	141 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	ALG5	P40350	334 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YIL067C	P40514	678 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	MLC1	P53141	149 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	PIB2	P53191	635 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	PIR3	Q03180	325 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	NCB2	Q92317	146 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YPT6	Q99260	215 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	EXO70	P19658	623 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YIM1	P28625	365 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	MRP4	P32902	394 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	SEF1	P34228	1148 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.07	□□□□□ -1.92	not detected
PEX18	YHR160C	ELP2	P42935	788 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	ARK1	P53974	638 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	NKP2	Q06162	153 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YEH1	Q07804	573 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	HUA2	Q12134	243 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	RAD50	P12753	1312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	SWE1	P32944	819 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	MSR1	P38714	643 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	NDT80	P38830	627 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	FAU1	P40099	211 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	OPY2	Q06810	360 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YDL121C	Q07541	149 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	RLM1	Q12224	676 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	HIP1	P06775	603 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YME1	P32795	747 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	GCD10	P41814	478 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	AVT4	P50944	713 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	VID30	P53076	958 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YDR056C	Q12025	205 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	TMS1	Q12116	473 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	NMD4	Q12129	218 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	ERV2	Q12284	196 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	LAA1	P39526	2014 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	COR1	P07256	457 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	BUB3	P26449	341 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YBL059W	P34224	193 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	FRE2	P36033	711 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	RRT2	P38332	387 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	PBA1	Q05778	276 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	BSC6	Q08280	497 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	RIM20	Q12033	661 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	HEM15	P16622	393 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	COQ1	P18900	473 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	SWD3	P38123	315 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YBL028C	P38202	106 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	MBB1	P39534	108 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	FLC2	P39719	783 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	YFL067W	P43537	175 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	RRT5	P43607	289 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92

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