RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	PHO13	P19881	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	GIT1	P25346	518 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YBR062C	P38239	180 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YER010C	P40011	234 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	GTO1	P48239	356 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	TAF6	P53040	516 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RMR1	P53060	241 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	TWF1	P53250	332 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YGR151C	P53287	111 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	SOL4	P53315	255 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	CAF40	P53829	373 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	ATG4	P53867	494 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	MET14	Q02196	202 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	TMN2	Q04562	672 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.76	□□□□□ -1.81	not detected
RIM4	YHL024W	AKR2	Q12013	749 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	GET4	Q12125	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	ATP6	P00854	259 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	CHS1	P08004	1131 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	WHI2	P12611	486 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	GAL3	P13045	520 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	HOP1	P20050	605 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	FUB1	P25659	250 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RIM4	P38741	713 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	VPS45	P38932	577 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	BUD16	P39988	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RGI2	P40188	164 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	ALG8	P40351	577 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	ICE2	P40499	491 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	LOH1	P47055	219 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YJL016W	P47072	561 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	ASE1	P50275	885 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	COS6	P53344	381 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	SNF12	P53628	566 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	SNA4	Q07549	140 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RAX1	Q08760	435 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	TY3A-G	Q12173	290 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	ATG34	Q12292	412 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	MED1	Q12321	566 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	DCN1	Q12395	269 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	GIS3	Q12418	502 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	TY3A-I	Q99219	290 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	URA3	P03962	267 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	PCK1	P10963	549 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	SPO16	P17122	198 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	UTR1	P21373	530 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	VAM7	P32912	316 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	SCO2	P38072	301 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	HMT1	P38074	348 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	SEN34	P39707	275 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	GSM1	P42950	618 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	FMP32	P43557	207 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	PIP2	P52960	996 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	COG1	P53079	417 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	YNR071C	P53757	342 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	KTR6	P54070	446 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	PLM2	Q04383	521 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RCO1	Q04779	684 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	RRT8	Q08219	342 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	USO1	P25386	1790 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	MET2	P08465	486 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RIM4	YHL024W	POL3	P15436	1097 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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