RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRX1	YBL064C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	SUR1	P33300	382 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	PPZ2	P33329	710 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	MSN2	P33748	704 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	DAD2	P36162	133 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	MMS4	P38257	691 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	VHC1	P38329	1120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	BUD32	P53323	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	CAC2	Q04199	468 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	OSW1	Q08692	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	AEP3	Q12089	606 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	GAL4	P04386	881 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ATP10	P18496	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	HNM1	P19807	563 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	TYR1	P20049	452 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	KRE2	P27809	442 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	YPT53	P36019	220 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	DUG2	P38149	878 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	VRG4	P40107	337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	VHS2	P40463	436 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	YJR154W	P47181	346 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ORM2	Q06144	216 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RRD2	Q12461	358 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	BNI1	P41832	1953 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	PDR11	P40550	1411 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	MMS1	Q06211	1407 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	YPR089W	O13585	888 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	MBR1	P23493	339 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	GEX1	P25596	615 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	BEM1	P29366	551 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	SNC1	P31109	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ATP11	P32453	318 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	PCH2	P38126	564 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	YSW1	P38280	609 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	LEU5	P38702	357 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
PRX1	YBL064C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	NMD5	P46970	1048 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	KEL2	P50090	882 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	MLC1	P53141	149 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	OCA2	P53949	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RRN5	Q02983	363 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RSC9	Q03124	581 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	PPM1	Q04081	328 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	POS5	Q06892	414 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	SSK1	Q07084	712 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	MTR10	Q99189	972 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	NUP192	P47054	1683 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	BNR1	P40450	1375 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	SUC2	P00724	532 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	SIN4	P32259	974 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	FLO10	P36170	1169 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	WSS1	P38838	269 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	FAD1	P38913	306 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	VPS45	P38932	577 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	SYG1	P40528	902 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	POP1	P41812	875 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	VPS25	P47142	202 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ALT2	P52892	507 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RHO4	Q00246	291 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	VTC3	Q02725	835 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	MDM30	Q05930	598 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ARV1	Q06541	321 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	LTE1	P07866	1435 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ERG11	P10614	530 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	BAR1	P12630	587 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	YEL043W	P32618	956 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	MLH1	P38920	769 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	YIL089W	P40500	205 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	SNO3	P43544	222 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	EPL1	P43572	832 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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