RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM50Q86XT4 487 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 SIK1P57059 783 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 SLFN14P0C7P3 912 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 RAB20Q9NX57 234 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 SARM1Q6SZW1 724 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 PNMA1Q8ND90 353 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 GJA10Q969M2 543 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 PANK4Q9NVE7 773 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 RCN2Q14257 317 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC41Q15345 812 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 GALNT17Q6IS24 598 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 NLRX1Q86UT6 975 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 TNNI1P19237 187 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 PANX2Q96RD6 677 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 HESX1Q9UBX0 185 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 TBK1Q9UHD2 729 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 PIK3C2BO00750 1634 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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