RNA–Protein interactions for RNA: YOR068C

VAM10, Transcript of Protein involved in vacuole morphogenesis, yeast

Gene VAM10, Length 345 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAM10	YOR068C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	UTR1	P21373	530 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MBR1	P23493	339 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YSP3	P25036	478 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YIH1	P25637	258 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MEI4	P29467	408 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GSH1	P32477	678 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	OCT1	P35999	772 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	APD1	P38281	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YMR262W	P38430	313 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PRM9	P39551	298 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	BUR6	P40096	142 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	NET1	P47035	1189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YGL242C	P53066	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	NGL3	Q03210	505 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	RSN1	Q03516	953 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YML037C	Q03703	340 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	VPS38	Q05919	439 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YLR173W	Q06247	608 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	BSP1	Q06604	576 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SNA4	Q07549	140 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	TLG2	Q08144	397 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	FRE7	Q12333	620 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	NDJ1	Q12366	352 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SRN2	Q99176	213 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
VAM10	YOR068C	PCT1	P13259	424 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SEC62	P21825	274 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	CMK2	P22517	447 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MAK32	P23060	363 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ADH7	P25377	361 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GID7	P25569	745 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	TPO5	P36029	618 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	BZZ1	P38822	633 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ERV46	P39727	415 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SCC4	P40090	624 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	BNA6	P43619	295 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MSY1	P48527	492 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	RMR1	P53060	241 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YNL181W	P53878	407 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	INA17	Q02888	182 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	CSI1	Q04368	295 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MSC3	Q05812	728 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YEH1	Q07804	573 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	BI2	P03873	423 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ARG80	P07249	177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	APE1	P14904	514 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	CPR2	P23285	205 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	KRE2	P27809	442 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	HXT1	P32465	570 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PMT1	P33775	817 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	HEL1	P36113	551 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	VID24	P38263	362 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	DOT5	P40553	215 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	DSN1	P40568	576 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	IRC8	P47046	822 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	LOH1	P47055	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	APS3	P47064	194 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	DIA3	P52290	468 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YGR117C	P53270	476 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YGR127W	P53275	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ATP23	P53722	227 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	IPI3	P53877	555 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	AQR1	P53943	586 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	VAC7	P53950	1165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PET117	Q02771	107 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ABZ2	Q03266	374 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YDR239C	Q03780	787 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	BNA7	Q04066	261 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ARP10	Q04549	284 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GMC2	Q06201	188 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YOL107W	Q12239	342 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	CTF3	Q12748	733 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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