RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	GUF1	P46943	645 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	SNA4	Q07549	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
HMS1	YOR032C	GEP3	Q08622	556 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	VAM3	Q12241	283 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	GPM3	Q12326	303 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	URA4	P20051	364 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	BRF1	P29056	596 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	HIR2	P32480	875 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	EFM2	P38347	419 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	LCB2	P40970	561 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	YJL055W	P47044	245 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	ACL4	Q03771	387 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	DCI1	Q08558	271 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	MED2	Q12124	431 aa		4.21	□□□□□ -1.73
HMS1	YOR032C	GLN3	P18494	730 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	MET30	P39014	640 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	FAU1	P40099	211 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YIL169C	P40442	995 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	DSL1	P53847	754 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RBA50	Q04418	439 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	HSP31	Q04432	237 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	FMP42	Q04991	504 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	BNA5	Q05979	453 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	MMR1	Q06324	491 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SYO1	Q07395	620 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RGT2	Q12300	763 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SPO7	P18410	259 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	BUB3	P26449	341 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	KRE2	P27809	442 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	FRE1	P32791	686 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	LTV1	P34078	463 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	IRC15	Q02733	499 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	VPS74	Q06385	345 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SRL1	Q08673	210 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	AEP3	Q12089	606 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RRD2	Q12461	358 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	CLN1	P20437	546 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YCR043C	P25361	127 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	PPZ1	P26570	692 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	BEM1	P29366	551 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SIN4	P32259	974 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RSM22	P36056	628 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	VPS52	P39904	641 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	DCS1	Q06151	350 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RHB1	P25378	209 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YHR054C	P38780	354 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	APE4	P38821	490 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	BZZ1	P38822	633 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	ELP2	P42935	788 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YJL132W	P47014	750 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	UAF30	Q08747	228 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RKM5	Q12367	367 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	OPI1	P21957	404 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RXT2	P38255	430 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SER3	P40054	469 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SAS2	P40963	338 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SAD1	P43589	448 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	IKS1	P47042	667 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	PEX25	Q02969	394 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	SEC63	P14906	663 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	GEX1	P25596	615 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RIM2	P38127	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	RFC3	P38629	340 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	MDM30	Q05930	598 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	MTR10	Q99189	972 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HMS1	YOR032C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75

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