RNA–Protein interactions for RNA: YAL059W

ECM1, Transcript of Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export, yeast

Gene ECM1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM1	YAL059W	IMO32	P53219	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	SMA2	Q04658	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	DCS1	Q06151	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	VAC14	Q06708	880 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	SFG1	Q12507	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	MRP13	P12686	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	GAL3	P13045	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	CNE1	P27825	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YKR015C	P36111	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	STV1	P37296	890 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YHR045W	P38775	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YRB2	P40517	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	CIN1	P40987	1014 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	BRO1	P48582	844 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	DIA3	P52290	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YGL185C	P53100	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YGL117W	P53133	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	PIB2	P53191	635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	CPR8	P53728	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YAT1	P80235	687 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	SPO19	Q03029	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	USA1	Q03714	838 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	RRN11	Q04712	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	ARG7	Q04728	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	GTO3	Q04806	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	CRN1	Q06440	651 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	ARG81	P05085	880 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	SAG1	P20840	650 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	PDE1	P22434	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YCL068C	P25593	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YIM1	P28625	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	BEM1	P29366	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	GSH1	P32477	678 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YBR139W	P38109	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	SWC5	P38326	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	TAE1	P38340	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	LNP1	P38878	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	PET100	P38958	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	SCC4	P40090	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YGR079W	P53249	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YGR126W	P53274	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	RTT102	P53330	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	DSL1	P53847	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	KTR6	P54070	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	FMP30	Q02883	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	ERV41	Q04651	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	STE23	Q06010	1027 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	APC2	Q12440	853 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	MTR10	Q99189	972 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	GID7	P25569	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YBR144C	P34215	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	ARA1	P38115	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	YER085C	P40058	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	VHS2	P40463	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	FAR3	P46671	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	TOM22	P49334	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	WAR1	Q03631	944 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECM1	YAL059W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	DAL81	P21657	970 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SEC62	P21825	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	BUD2	P33314	1104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YPT53	P36019	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	UBX6	P47049	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	TIM21	P53220	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YGR117C	P53270	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	COQ6	P53318	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	EFM6	P53970	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RSN1	Q03516	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	EKI1	Q03764	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RRG8	Q06109	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	GPN3	Q06543	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	OSW1	Q08692	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SRN2	Q99176	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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