RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524509.1

PACSIN3-202, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-202ENST00000524509 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 MEIS2O14770 477 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 CYP2C19P33261 490 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 TBC1D5Q92609 795 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 ALG1Q9BT22 464 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 PXMP2Q9NR77 195 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.12■□□□□ 0.81
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PACSIN3-202ENST00000524509 CTDNEP1O95476 244 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 EDNRBP24530 442 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 CCND2P30279 289 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 ACVR2BQ13705 512 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 LTBP2Q14767 1821 aa20.11■□□□□ 0.81
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PACSIN3-202ENST00000524509 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 SEPT4O43236 478 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 NR3C2P08235 984 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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PACSIN3-202ENST00000524509 DNM1LO00429 736 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 CYBAP13498 195 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 AKR1A1P14550 325 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 CNGA1P29973 690 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 GNPTABQ3T906 1256 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 FGD4Q96M96 766 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 PPFIA3O75145 1194 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 BLIDQ8IZY5 108 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 SPC25Q9HBM1 224 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 COL20A1Q9P218 1284 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-202ENST00000524509 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 RTP1P59025 263 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 CUL4AQ13619 759 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 PGM5Q15124 567 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 SCFD2Q8WU76 684 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 CDHR1Q96JP9 859 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 C8orf76Q96K31 380 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 MYH6P13533 1939 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 MAFGO15525 162 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 JAK2O60674 1132 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 TGFB3P10600 412 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 RARBP10826 455 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 PDCP20941 246 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 TTLL4Q14679 1199 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 SHHQ15465 462 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 UBE2SQ16763 222 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 NLRX1Q86UT6 975 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 Q9Y3F1 56 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 ASTN1O14525 1302 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 KRT2P35908 639 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 ST3GAL1Q11201 340 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 BECN1Q14457 450 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 ANO3Q9BYT9 981 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 CDH23Q9H251 3354 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 SREBF1P36956 1147 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 TNFAIP2Q03169 654 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-202ENST00000524509 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.04■□□□□ 0.8
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