RNA–Protein interactions for RNA: YLR414C

PUN1, Transcript of Plasma membrane protein with a role in cell wall integrity, yeast

Gene PUN1, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUN1	YLR414C	YLL007C	Q07799	665 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	OPI10	Q08202	246 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	RAD59	Q12223	238 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	PSY3	Q12318	242 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YSR3	P23501	404 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	GLG1	P36143	616 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YBR241C	P38142	488 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	SLM4	P38247	162 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YEL073C	P39974	107 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	GAB1	P41733	394 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	NBP35	P52920	328 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	MTO1	P53070	669 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YNR061C	P53747	219 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YNL095C	P53932	642 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YPR084W	Q06821	456 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YOL159C	Q08300	171 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YLL054C	Q12244	843 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	HXT4	P32467	576 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	SKG1	P36169	355 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YBR071W	P38243	211 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YHR218W	P38899	603 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	HXT7	P39004	570 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	CAB2	P40506	365 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	SNL1	P40548	159 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	AIM22	P47051	409 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	GCV1	P48015	400 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	NPY1	P53164	384 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	ASI2	P53895	289 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	VPS68	Q12016	184 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	KAR1	P11927	433 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	PRI2	P20457	528 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YHL012W	P38709	493 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	CCH1	P50077	2039 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	GOR1	P53839	350 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	GIP3	Q03016	1276 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	PEX12	Q04370	399 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	YPR097W	Q06839	1073 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	DAP1	Q12091	152 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUN1	YLR414C	INH1	P01097	85 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	MRPS28	P21771	286 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	CDC5	P32562	705 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	COS7	Q07788	383 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	NMD4	Q12129	218 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	NTO1	Q12311	748 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	RAP1	P11938	827 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	ATR1	P13090	542 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	CMK2	P22517	447 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	PEX3	P28795	441 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	COS111	P38308	924 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	RIC1	P40395	1056 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	BSC2	Q05611	235 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	SNF8	Q12483	233 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	SNF4	P12904	322 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	COS12	P53053	380 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	RMR1	P53060	241 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	YNR068C	P53754	272 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	AAT1	Q01802	451 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	YKU80	Q04437	629 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	NDL1	Q06568	189 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	PLB3	Q08108	686 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	NKP1	Q12493	238 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	DMC1	P25453	334 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	MDJ1	P35191	511 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	SPT23	P35210	1082 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	DMA1	P38823	416 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	ATG7	P38862	630 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	RBG1	P39729	369 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	MTW1	P39731	289 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	VHR1	P40522	640 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	AGP3	P43548	558 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	TOM22	P49334	152 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	SPO19	Q03029	223 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.05	□□□□□ -0.32	not detected
PUN1	YLR414C	GET4	Q12125	312 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	YOR342C	Q12182	319 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUN1	YLR414C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32

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