RNA–Protein interactions for RNA: YLR220W

CCC1, Transcript of Vacuolar Fe2+/Mn2+ transporter, yeast

Gene CCC1, Length 969 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CCC1	YLR220W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	NMD4	Q12129	218 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	RKM5	Q12367	367 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	IRA2	P19158	3079 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	PMR1	P13586	950 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	TRX3	P25372	127 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	SFC1	P33303	322 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	YHL008C	P38750	627 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	14.96	□□□□□ -0.01	not detected
CCC1	YLR220W	PLB1	P39105	664 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	CAB2	P40506	365 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	APQ12	P40532	138 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	YJL049W	P47048	450 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	GTO1	P48239	356 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	BSC2	Q05611	235 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	MCH5	Q08777	521 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	YIG1	Q08956	461 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	YPR202W	Q08993	238 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	DIN7	Q12086	430 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CCC1	YLR220W	CMP2	P14747	604 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	SKN1	P33336	771 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	MPS3	P47069	682 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	GTB1	Q04924	702 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YDR338C	Q05497	695 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	BNA5	Q05979	453 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	SGT1	Q08446	395 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	OSW1	Q08692	278 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YOL107W	Q12239	342 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	JLP1	Q12358	412 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	PHO81	P17442	1178 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	BUB3	P26449	341 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	FUN30	P31380	1131 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	AZF1	P41696	914 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	MEP2	P41948	499 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	AIM22	P47051	409 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	NNF2	P53253	936 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	ROY1	Q04847	553 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	HUA2	Q12134	243 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YOR114W	Q12219	294 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	GAL7	P08431	366 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	DGR2	P32330	852 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	RRN10	P38204	145 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	MET30	P39014	640 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	AYR1	P40471	297 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	PIN2	Q12057	282 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YLL054C	Q12244	843 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YDR262W	Q12331	272 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	ATP6	P00854	259 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	MRP13	P12686	339 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	SPS22	P25380	463 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	ADE1	P27616	306 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YNL140C	P53910	189 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	MET31	Q03081	177 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	BNI4	P53858	892 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YPR022C	Q12139	1133 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	TYR1	P20049	452 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	CBP4	P37267	147 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	FZO1	P38297	855 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	VRG4	P40107	337 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	COG2	P53271	262 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	RPM2	Q02773	1202 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	STP3	Q05937	343 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	NSL1	Q12143	216 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CCC1	YLR220W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	PTP1	P25044	335 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	TY2A-C	P25383	438 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	ATG7	P38862	630 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	DIA3	P52290	468 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	TY2A-B	Q12260	438 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CCC1	YLR220W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		14.89	□□□□□ -0.03

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