RNA–Protein interactions for RNA: YKR085C

MRPL20, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL20, Length 588 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL20	YKR085C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	RPS27B	P38711	82 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YAR028W	P39548	234 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	SAW1	P39735	261 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	LCL3	P53153	274 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	JJJ1	P53863	590 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ALF1	P53904	254 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	DMA2	P53924	522 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	THI7	Q05998	598 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	SPS100	P13130	326 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YKL077W	P36081	392 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	APT2	P36973	181 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YBR139W	P38109	508 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MAL32	P38158	584 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	HSE1	P38753	452 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	VPS52	P39904	641 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YGR012W	P53206	393 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ALG12	P53730	551 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	TIM10	P87108	93 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	AAT1	Q01802	451 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MET14	Q02196	202 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YPL068C	Q02749	293 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	RSA1	Q08932	381 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	INO1	P11986	533 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	PTC6	P25646	442 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	SEC65	P29478	273 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MLS1	P30952	554 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	INM1	P38710	295 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MND2	P40577	368 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	PXA1	P41909	870 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MET12	P46151	657 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ALY2	P47029	1046 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ATG4	P53867	494 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	PET117	Q02771	107 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YLR287C	Q05881	355 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	NUT2	Q06213	157 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	RSC58	Q07979	502 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	KAR1	P11927	433 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MAK32	P23060	363 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MGR1	P25573	417 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YCR099C	P25657	155 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ZIP1	P31111	875 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	DCG1	P32460	244 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	TIP20	P33891	701 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YDR089W	P38966	869 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MET30	P39014	640 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	SPC72	P39723	622 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	FMP52	P40008	231 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YIL152W	P40455	235 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	PRM2	P40534	656 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YML6	P51998	286 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MAL12	P53341	584 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	IBD2	P53892	351 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	UME1	Q03010	460 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	NGL3	Q03210	505 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ATG16	Q03818	150 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ROY1	Q04847	553 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MMT2	Q08970	484 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	HOS1	Q12214	470 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	CLN2	P20438	545 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ADE1	P27616	306 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	DTR1	P38125	572 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	PCH2	P38126	564 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MRP21	P38175	177 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	RRN10	P38204	145 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	HIS2	P38635	335 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	CKB2	P38930	258 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	MSS4	P38994	779 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	ECO1	P43605	281 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	IRC6	P43615	237 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MRPL20	YKR085C	BOP2	Q06150	570 aa		3.84	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.9 ms