RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W RDR1Q08904 546 aa2.71□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YPL150WQ12152 901 aa2.71□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W IES3Q12345 250 aa2.71□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W LCB1P25045 558 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W MCM4P30665 933 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W ACH1P32316 526 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W MAL33P38157 468 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W MDM31P38880 579 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SHC1P39000 512 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W VID27P40157 782 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SEC27P41811 889 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W IME4P41833 600 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SHE10P53075 577 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W ADA2Q02336 434 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SPC24Q04477 213 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W VAC14Q06708 880 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W FMP45Q07651 309 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RIM20Q12033 661 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SNF3P10870 884 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SRB4P32569 687 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W PTH2P34222 208 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SRL3P36167 246 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W PIM1P36775 1133 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W PSY4P38193 441 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W ANS1P38832 159 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SEC24P40482 926 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W AXL1P40851 1208 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SAP185P40856 1058 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W GPD2P41911 440 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W DSD1P53095 428 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W ORM1P53224 222 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RPM2Q02773 1202 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W MSS11Q03825 758 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YLR177WQ06251 628 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YEH2Q07950 538 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W INP53Q12271 1107 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W OCA6Q12454 224 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W BCK1Q01389 1478 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W ATS1P31386 333 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W CBF2P32504 956 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RIB7P33312 244 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YKL050CP35736 922 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W AVT5P38176 459 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data2.69□□□□□ -1.98not detected
YKR078WYKR078W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SMF1P38925 575 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SMK1P41808 388 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W STB1P42845 420 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W IKS1P47042 667 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RBL2P48606 106 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W BOR1P53838 576 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W UBX4P54730 416 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YKR005CQ02203 525 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RCF1Q03713 159 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W PLP1Q04004 230 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SMA2Q04658 369 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W ARP6Q12509 438 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YBR085C-AO43137 85 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W LPD1P09624 499 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W CBS2P14905 389 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SAN1P22470 610 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W XRS2P33301 854 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W CSE1P33307 960 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W FES1P38260 290 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W FZO1P38297 855 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W UIP3P39547 235 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W SYG1P40528 902 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W VTC2P43585 828 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W FYV8P46949 817 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YDL186WP48568 277 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W FMS1P50264 508 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W ZDS2P54786 942 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YML108WQ03759 105 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W MGR3Q04472 501 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W TAF10Q12030 206 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W VIK1Q12045 647 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W NUS1Q12063 375 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W NCB2Q92317 146 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR078WYKR078W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms