RNA–Protein interactions for RNA: YKR077W

MSA2, Transcript of Putative transcriptional activator, yeast

Gene MSA2, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSA2	YKR077W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	ROX1	P25042	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	PMT1	P33775	817 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	HXT14	P42833	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	SLG1	P54867	378 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	IRC15	Q02733	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	PPT2	Q12036	173 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	GRX6	Q12438	231 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	SET6	Q12529	373 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	ATS1	P31386	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	SPC110	P32380	944 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	RPH1	P39956	796 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	TAF11	Q04226	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	RTT103	Q05543	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	VPS74	Q06385	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	SMF1	P38925	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	RPR2	P40571	144 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	CYB2	P00175	591 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	RED1	P14291	827 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	ATP11	P32453	318 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	SHO1	P40073	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	POP1	P41812	875 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	ELP2	P42935	788 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	SRB7	P47822	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	YDL186W	P48568	277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	YGL108C	P53139	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	TAP42	Q04372	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	AYT1	Q12226	474 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	YCR022C	P25620	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	SYG1	P40528	902 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	YJL213W	P40896	331 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	URB2	P47108	1174 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	RTN2	Q12443	393 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	JNM1	P36224	373 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	ALG8	P40351	577 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	COS10	P52924	374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	RKM5	Q12367	367 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	ATR1	P13090	542 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	BUB3	P26449	341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	RAD14	P28519	371 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	ERG3	P32353	365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	PMU1	P36069	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	CBP4	P37267	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	HAT2	P39984	401 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	FAU1	P40099	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	GWT1	P47026	490 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	HEM2	P05373	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	RHO2	P06781	192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	AFG1	P32317	509 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	YGR149W	P48236	432 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
MSA2	YKR077W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	RSM22	P36056	628 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	TUL1	P36096	758 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	KRE9	P39005	276 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	SCM3	Q12334	223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	SPS4	P09937	338 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	AGA1	P32323	725 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	SOV1	Q04748	898 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	ATP10	P18496	279 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	NPL6	P32832	435 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	FRE2	P36033	711 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	THI2	P38141	450 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	VTA1	Q06263	330 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSA2	YKR077W	SFI1	Q12369	946 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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