RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	ERV2	Q12284	196 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SCS22	Q6Q595	175 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YOR304C-A	O14468	76 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SLM4	P38247	162 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PEX32	P38292	413 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NIT2	P47016	307 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	APS3	P47064	194 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BNA7	Q04066	261 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AKR2	Q12013	749 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DIN7	Q12086	430 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	KCS1	Q12494	1050 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPT23	P35210	1082 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BET3	P36149	193 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CBP4	P37267	147 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RDH54	P38086	958 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YIL054W	P40524	105 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRH4	P53166	561 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HMG2	P12684	1045 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PHO13	P19881	312 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CSM2	P40465	213 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MDJ2	P42834	146 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ROG1	P53118	685 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YNL143C	P53908	130 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PHM6	Q05637	104 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RRD2	Q12461	358 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PPZ1	P26570	692 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CTF8	P38877	133 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NPP2	P39997	493 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SOK1	P40317	901 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AAD14	P42884	376 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ALR2	P43553	858 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RSM26	P47141	266 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ROD1	Q02805	837 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YML037C	Q03703	340 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CNL1	Q06333	122 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YFH1	Q07540	174 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ISA2	Q12425	185 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YPR1	Q12458	312 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AGC1	Q12482	902 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HSF1	P10961	833 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SNF5	P18480	905 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ZRC1	P20107	442 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AHC2	P25649	128 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YHR033W	P38690	423 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MIT1	P40002	666 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RSM27	P53305	110 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPO71	Q03868	1245 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPR28	Q04921	423 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AIM6	Q07716	390 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SNF4	P12904	322 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CPS1	P27614	576 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRPL4	P36517	319 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YBR242W	P38331	238 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SFB3	P38810	929 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRX6	P48564	524 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YPL272C	Q08984	517 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YPL150W	Q12152	901 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	STE12	P13574	688 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AGP1	P25376	633 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SSN3	P39073	555 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YFR006W	P43590	535 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ATG18	P43601	500 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TAH11	P47112	604 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RTT102	P53330	157 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GTO3	Q04806	366 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DUS4	Q06063	367 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YPR114W	Q06107	315 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	APM3	P38153	483 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ZRG8	P40021	1076 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PKP1	P40530	394 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TDA10	P42938	290 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98

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