RNA–Protein interactions for RNA: YDL093W

PMT5, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT5	YDL093W	COT1	P32798	439 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	HES1	P35843	434 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	PXL1	P36166	706 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MLH1	P38920	769 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	PLB1	P39105	664 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MRP13	P12686	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	CDC15	P27636	974 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	NTH1	P32356	751 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ELF1	P36053	145 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MRPL37	P36532	105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	SSO2	P39926	295 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ELO3	P40319	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ALG5	P40350	334 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ASG1	P40467	964 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	NPA3	P47122	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ECM27	P47144	725 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	PIB2	P53191	635 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MLH3	Q12083	715 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ATG9	Q12142	997 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	AHC1	Q12433	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	VPS63	O13549	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	CDC42	P19073	191 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	CNE1	P27825	502 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	SRB4	P32569	687 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	GLG1	P36143	616 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MRPL4	P36517	319 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MNL1	P38888	796 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	BUL1	P48524	976 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MUP1	P50276	574 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YGL138C	P53122	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	GCN5	Q03330	439 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ARG7	Q04728	441 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	BCP1	Q06338	283 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	TAF3	Q12297	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	SFG1	Q12507	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	HIP1	P06775	603 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	PET111	P08468	800 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	VMA16	P23968	213 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YFR018C	P43599	363 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	IRC8	P47046	822 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	CGR1	P53188	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	RXT3	Q07458	294 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	CBP1	P07252	654 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	COQ2	P32378	372 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YKL070W	P36087	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	SLX1	P38324	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	AFG3	P39925	761 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YTA12	P40341	825 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MSS2	P40990	351 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	STB2	P46679	850 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	SNO2	P53823	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	KTR6	P54070	446 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMT5	YDL093W	COX1	P00401	534 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	STE3	P06783	470 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	ADH7	P25377	361 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
PMT5	YDL093W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	HCS1	P34243	683 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	YBR139W	P38109	508 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	PFF1	P38244	976 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	SIP3	P38717	1229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	PHM8	P40025	321 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	YGR035C	P53222	116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	RSM28	Q03430	361 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	ACL4	Q03771	387 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	ENB1	Q08299	606 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	CYC7	P00045	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	ELO2	P25358	347 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	BOS1	P25385	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT5	YDL093W	FUB1	P25659	250 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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