RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	RIM21	P48565	533 aa		6.88	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	ASF1	P32447	279 aa		6.86	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	TGL3	P40308	642 aa		6.86	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	RSC30	P38781	883 aa		6.85	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	ITT1	Q04638	464 aa		6.85	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	TFB4	Q12004	338 aa		6.85	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	SEC20	P28791	383 aa		6.84	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	YPP1	P46951	817 aa		6.84	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	LAM6	Q08001	693 aa		6.84	□□□□□ -1.31
RPS0B	YLR048W	PEP12	P32854	288 aa		6.83	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	SLI15	P38283	698 aa		6.83	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	IPL1	P38991	367 aa		6.83	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		6.83	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	6.82	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	HTA2	P04912	132 aa		6.82	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	SLY41	P22215	453 aa		6.81	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	PEX21	P50091	288 aa		6.81	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	ECM23	Q02710	187 aa		6.81	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	GTT3	P39996	337 aa		6.8	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	6.8	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	DAN4	P47179	1161 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	CDC73	Q06697	393 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	YOL036W	Q08206	761 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	ERP5	P38819	212 aa		6.78	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	KTR7	P40504	517 aa		6.78	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	YTA7	P40340	1379 aa		6.78	□□□□□ -1.32
RPS0B	YLR048W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	SET4	P42948	560 aa		6.77	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	ALD2	P47771	506 aa		6.77	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	YNL115C	P53925	644 aa		6.77	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	MCM16	Q12262	181 aa		6.77	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	GAL2	P13181	574 aa		6.76	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	UBX7	P38349	436 aa		6.76	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.76	□□□□□ -1.33	not detected
RPS0B	YLR048W	RTF1	P53064	558 aa		6.76	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	MST1	P07236	462 aa		6.75	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	OCA5	P38738	679 aa		6.74	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	KAR5	Q04746	504 aa		6.74	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	PUS6	P53294	404 aa		6.73	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	ENV9	Q08651	330 aa		6.73	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	YHL050C	P38721	697 aa		6.72	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	YHR219W	P38900	624 aa		6.72	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	YEL023C	P39992	682 aa		6.72	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	POL32	P47110	350 aa		6.72	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	SVF1	Q05515	481 aa		6.72	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		6.72	□□□□□ -1.33
RPS0B	YLR048W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	YRR1	Q12172	810 aa		6.71	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	ATE1	P16639	503 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	ISF1	P32488	338 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	BRN1	P38170	754 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	PPX1	P38698	397 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	MDJ2	P42834	146 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	NNF1	P47149	201 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	MSB4	Q12317	492 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	EMP47	P43555	445 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	PHO87	P25360	923 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	PTC4	P38089	393 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	ATG3	P40344	310 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	TBF1	Q02457	562 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	KEX2	P13134	814 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	THI12	P42883	340 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	THI5	P43534	340 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	THI11	P47183	340 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	ATG1	P53104	897 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	DPL1	Q05567	589 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	THI13	Q07748	340 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	WHI5	Q12416	295 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	HAP4	P14064	554 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	DOS2	P54858	310 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	PNP1	Q05788	311 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RPS0B	YLR048W	SEC8	P32855	1065 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	SPC42	P36094	363 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	ERF2	Q06551	359 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	FRA1	Q07825	749 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	ISU2	Q12056	156 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	MGE1	P38523	228 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	BOL3	P39724	118 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	ACF4	P47129	309 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	ROM1	P53046	1155 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	PUN1	Q06991	263 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	SRS2	P12954	1174 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	TEC1	P18412	486 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPS0B	YLR048W	GUT2	P32191	649 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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