RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W ENO2P00925 437 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W ENO1P00924 437 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W JIP4Q03361 876 aa7.28□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W LAM6Q08001 693 aa7.28□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W YRR1Q12172 810 aa7.28□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W CDC3P32457 520 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W RSC30P38781 883 aa7.27□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W DPL1Q05567 589 aa7.27□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W SLD2P34252 453 aa7.26□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W SIS2P36024 562 aa7.26□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W YNL115CP53925 644 aa7.26□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W PUP1P25043 261 aa7.25□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W RTF1P53064 558 aa7.25□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W YML083CQ04526 418 aa7.25□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W MRX10Q05648 414 aa7.25□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W MID1P41821 548 aa7.24□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W RIM21P48565 533 aa7.24□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W MPC54Q08550 464 aa7.23□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W ULI1P43604 169 aa7.22□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W PML39Q03760 334 aa7.22□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W ISU2Q12056 156 aa7.22□□□□□ -1.25
YKR047WYKR047W KEX2P13134 814 aa7.2□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W TGL4P36165 910 aa7.2□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.2□□□□□ -1.26not detected
YKR047WYKR047W YPP1P46951 817 aa7.2□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W PUS6P53294 404 aa7.2□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W PEX29Q03370 554 aa7.2□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W YBL029C-AQ3E756 94 aa7.2□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W VNX1P42839 908 aa7.19□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W NAF1P53919 492 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W NUD1P32336 851 aa7.18□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W MRX12P47084 519 aa7.18□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W TBF1Q02457 562 aa7.18□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W HAT1Q12341 374 aa7.18□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W ERF2Q06551 359 aa7.17□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W NMA111P53920 997 aa7.16□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W MCM16Q12262 181 aa7.16□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W PEP12P32854 288 aa7.15□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W NPL4P33755 580 aa7.15□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W KTR7P40504 517 aa7.15□□□□□ -1.26
YKR047WYKR047W ECM23Q02710 187 aa7.14□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W SPP1Q03012 353 aa7.14□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W IOC2Q12072 812 aa7.14□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W RDS2P19541 446 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W ISF1P32488 338 aa7.12□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W ENV9Q08651 330 aa7.12□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W PDR1P12383 1068 aa7.11□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W NOP7P53261 605 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W YDL206WQ12424 762 aa7.11□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W HEM3P28789 327 aa7.1□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W RTG1P32607 177 aa7.1□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W EMP47P43555 445 aa7.1□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W UBX7P38349 436 aa7.09□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W ISM1P48526 1002 aa7.09□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W SNU71P53207 620 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
YKR047WYKR047W GAL2P13181 574 aa7.08□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W SEC61P32915 480 aa7.08□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W AIM44Q99299 758 aa7.08□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W STR2P47164 639 aa7.07□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W LDB19Q12502 818 aa7.07□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W TEC1P18412 486 aa7.06□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W TUB4P53378 473 aa7.06□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W RAM1P22007 431 aa7.05□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W RPA14P50106 137 aa7.05□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W STE20Q03497 939 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W AGE1Q04412 482 aa7.05□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W YBL113CQ7M4S9 792 aa7.05□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W GUT2P32191 649 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W RRN6P32786 894 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W STM1P39015 273 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W ATG3P40344 310 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W HAP5Q02516 242 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W YDL129WQ07555 291 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W FRA1Q07825 749 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W ALR1Q08269 859 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YKR047WYKR047W TY1A-DR4O74302 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-AP0CX57 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-PR1P0CX58 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-ORP0CX59 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-PR2P0CX60 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-DR5P0CX65 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-ER2P0CX66 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-GR3P0CX67 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-LR1P0CX68 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-MR2P0CX69 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W FIG4P42837 879 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-JR2P47099 440 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR047WYKR047W TY1A-DR1Q03856 440 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.2 ms