RNA–Protein interactions for RNA: YKR018C

YKR018C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR018C, Length 2,178 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR018CYKR018C MET10P39692 1035 aa9.05□□□□□ -0.96
YKR018CYKR018C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
YKR018CYKR018C IML1P47170 1584 aa9.03□□□□□ -0.96
YKR018CYKR018C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
YKR018CYKR018C SIS2P36024 562 aa9.02□□□□□ -0.97
YKR018CYKR018C ESL2P36168 1195 aa9.02□□□□□ -0.97
YKR018CYKR018C MPP10P47083 593 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
YKR018CYKR018C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
YKR018CYKR018C HAP1P0CE41 1502 aa9.01□□□□□ -0.97
YKR018CYKR018C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data9□□□□□ -0.97not detected
YKR018CYKR018C BNR1P40450 1375 aa9□□□□□ -0.97
YKR018CYKR018C SPE2P21182 396 aa8.99□□□□□ -0.97
YKR018CYKR018C EDE1P34216 1381 aa8.97□□□□□ -0.97
YKR018CYKR018C MSP1P28737 362 aa8.97□□□□□ -0.97
YKR018CYKR018C VPS24P36095 224 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C IOC4Q04213 475 aa8.96□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C KNS1P32350 737 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C CTR9P89105 1077 aa8.95□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C TRM3Q07527 1436 aa8.94□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C DAL5P15365 543 aa8.93□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C FKH1P40466 484 aa8.93□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C NOT3P06102 836 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C RAD2P07276 1031 aa8.92□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C YAP3P38749 330 aa8.92□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C ARL1P38116 183 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C YIL092WP40497 633 aa8.92□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C SAP155P43612 1002 aa8.92□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C POL32P47110 350 aa8.92□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C RLF2Q12495 606 aa8.91□□□□□ -0.98
YKR018CYKR018C DNF3Q12674 1656 aa8.89□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C YPP1P46951 817 aa8.89□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C YML133CQ03099 1374 aa8.88□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C YLL067CQ07888 1374 aa8.88□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C YLL066CQ99208 1374 aa8.88□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C TEA1P47988 759 aa8.88□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C AIM44Q99299 758 aa8.88□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C TPD3P31383 635 aa8.86□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C MET5P47169 1442 aa8.86□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C SCT1P32784 759 aa8.86□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C TAF8Q03750 510 aa8.86□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C KRE5P22023 1365 aa8.85□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C THI22Q06490 572 aa8.85□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
YKR018CYKR018C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
YKR018CYKR018C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data8.82□□□□□ -1not detected
YKR018CYKR018C BCK1Q01389 1478 aa8.82□□□□□ -1
YKR018CYKR018C RAD9P14737 1309 aa8.82□□□□□ -1
YKR018CYKR018C QCR6P00127 147 aa8.82□□□□□ -1
YKR018CYKR018C NAP1P25293 417 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YKR018CYKR018C CSE4P36012 229 aa8.82□□□□□ -1
YKR018CYKR018C NOP58Q12499 511 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YKR018CYKR018C ITC1P53125 1264 aa8.81□□□□□ -1
YKR018CYKR018C PRD1P25375 712 aa8.8□□□□□ -1
YKR018CYKR018C YGR130CP53278 816 aa8.79□□□□□ -1
YKR018CYKR018C SRS2P12954 1174 aa8.78□□□□□ -1
YKR018CYKR018C RTT109Q07794 436 aa8.78□□□□□ -1
YKR018CYKR018C AVT3P36062 692 aa8.78□□□□□ -1
YKR018CYKR018C SIR4P11978 1358 aa8.77□□□□□ -1
YKR018CYKR018C RSC1P53236 928 aa8.76□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C HAP5Q02516 242 aa8.76□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C LCD1Q04377 747 aa8.75□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C YRF1-4O13559 1382 aa8.75□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C KAR2P16474 682 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C ALD4P46367 519 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C SPT21P35209 758 aa8.73□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C TYS1P36421 394 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C RKM3P38222 552 aa8.73□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C PSK1P31374 1356 aa8.73□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C USO1P25386 1790 aa8.73□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C RRT14P40470 206 aa8.72□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C NUP145P49687 1317 aa8.72□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C MCM2P29469 868 aa8.72□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C MDG1P53885 366 aa8.71□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C HIM1Q06674 414 aa8.71□□□□□ -1.01
YKR018CYKR018C DLD1P32891 587 aa8.71□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C NPA3P47122 385 aa8.71□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C CAB1Q04430 367 aa8.71□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C RAD26P40352 1085 aa8.7□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C YGL081WP53156 320 aa8.7□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C PAP2P53632 584 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C CIR1P42940 261 aa8.69□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C PIL1P53252 339 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C COG8Q04632 607 aa8.69□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C AUS1Q08409 1394 aa8.69□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C NKP2Q06162 153 aa8.69□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C BRN1P38170 754 aa8.68□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C URN1Q06525 465 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C RAD50P12753 1312 aa8.68□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C RVS167P39743 482 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.5 ms