RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629725.2

TARDBP-228, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5 BASIC

Gene TARDBP, Length 1,031 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-228	ENST00000629725	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.71	■■■□□ 2.99
TARDBP-228	ENST00000629725	PLCH2	O75038	1416 aa		33.7	■■■□□ 2.99
TARDBP-228	ENST00000629725	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TARDBP-228	ENST00000629725	ATP10A	O60312	1499 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TARDBP-228	ENST00000629725	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TARDBP-228	ENST00000629725	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TARDBP-228	ENST00000629725	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
TARDBP-228	ENST00000629725	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TARDBP-228	ENST00000629725	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TARDBP-228	ENST00000629725	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TARDBP-228	ENST00000629725	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TARDBP-228	ENST00000629725	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
TARDBP-228	ENST00000629725	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.5	■■■□□ 2.95
TARDBP-228	ENST00000629725	KIF14	Q15058	1648 aa		33.5	■■■□□ 2.95
TARDBP-228	ENST00000629725	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
TARDBP-228	ENST00000629725	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
TARDBP-228	ENST00000629725	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TARDBP-228	ENST00000629725	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.45	■■■□□ 2.95
TARDBP-228	ENST00000629725	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.45	■■■□□ 2.95
TARDBP-228	ENST00000629725	KDM5C	P41229	1560 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TARDBP-228	ENST00000629725	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TARDBP-228	ENST00000629725	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
TARDBP-228	ENST00000629725	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.41	■■■□□ 2.94
TARDBP-228	ENST00000629725	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
TARDBP-228	ENST00000629725	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TARDBP-228	ENST00000629725	CLIP1	P30622	1438 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TARDBP-228	ENST00000629725	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TARDBP-228	ENST00000629725	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TARDBP-228	ENST00000629725	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TARDBP-228	ENST00000629725	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TARDBP-228	ENST00000629725	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TARDBP-228	ENST00000629725	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TARDBP-228	ENST00000629725	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TARDBP-228	ENST00000629725	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TARDBP-228	ENST00000629725	C3	P01024	1663 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TARDBP-228	ENST00000629725	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TARDBP-228	ENST00000629725	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
TARDBP-228	ENST00000629725	ABCC1	P33527	1531 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TARDBP-228	ENST00000629725	AGL	P35573	1532 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TARDBP-228	ENST00000629725	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.2	■■■□□ 2.91
TARDBP-228	ENST00000629725	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.2	■■■□□ 2.91
TARDBP-228	ENST00000629725	PTPRT	O14522	1441 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TARDBP-228	ENST00000629725	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TARDBP-228	ENST00000629725	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TARDBP-228	ENST00000629725	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TARDBP-228	ENST00000629725	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TARDBP-228	ENST00000629725	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TARDBP-228	ENST00000629725	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TARDBP-228	ENST00000629725	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TARDBP-228	ENST00000629725	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TARDBP-228	ENST00000629725	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TARDBP-228	ENST00000629725	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TARDBP-228	ENST00000629725	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TARDBP-228	ENST00000629725	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TARDBP-228	ENST00000629725	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	SOCS7	O14512	581 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	NPAT	Q14207	1427 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TARDBP-228	ENST00000629725	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.86
TARDBP-228	ENST00000629725	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
TARDBP-228	ENST00000629725	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.91	■■■□□ 2.86	7e-7	■■□□□ 12.4
TARDBP-228	ENST00000629725	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
TARDBP-228	ENST00000629725	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TARDBP-228	ENST00000629725	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TARDBP-228	ENST00000629725	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TARDBP-228	ENST00000629725	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TARDBP-228	ENST00000629725	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TARDBP-228	ENST00000629725	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TARDBP-228	ENST00000629725	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TARDBP-228	ENST00000629725	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TARDBP-228	ENST00000629725	A2M	P01023	1474 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TARDBP-228	ENST00000629725	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
TARDBP-228	ENST00000629725	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TARDBP-228	ENST00000629725	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TARDBP-228	ENST00000629725	PKD2	Q13563	968 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TARDBP-228	ENST00000629725	GGT6	Q6P531	493 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TARDBP-228	ENST00000629725	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
TARDBP-228	ENST00000629725	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TARDBP-228	ENST00000629725	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TARDBP-228	ENST00000629725	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TARDBP-228	ENST00000629725	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TARDBP-228	ENST00000629725	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
TARDBP-228	ENST00000629725	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TARDBP-228	ENST00000629725	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TARDBP-228	ENST00000629725	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
TARDBP-228	ENST00000629725	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
TARDBP-228	ENST00000629725	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TARDBP-228	ENST00000629725	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TARDBP-228	ENST00000629725	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TARDBP-228	ENST00000629725	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TARDBP-228	ENST00000629725	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TARDBP-228	ENST00000629725	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TARDBP-228	ENST00000629725	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TARDBP-228	ENST00000629725	TNR	Q92752	1358 aa		32.48	■■■□□ 2.79

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