RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FMN1Q68DA7 1419 aa39.73■■■■□ 3.95
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF14Q15058 1648 aa39.69■■■■□ 3.94
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPA2P54652 639 aa39.68■■■■□ 3.94
CAPNS1-216ENST00000628306 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.68■■■■□ 3.94
CAPNS1-216ENST00000628306 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.66■■■■□ 3.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.63■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP10AO60312 1499 aa39.63■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.62■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MLECQ14165 292 aa39.6■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.6■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.58■■■■□ 3.93
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM5CP41229 1560 aa39.54■■■■□ 3.92
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.51■■■■□ 3.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.48■■■■□ 3.91
CAPNS1-216ENST00000628306 AFAP1Q8N556 730 aa39.47■■■■□ 3.91
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.43■■■■□ 3.9
CAPNS1-216ENST00000628306 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-216ENST00000628306 CLIP1P30622 1438 aa39.41■■■■□ 3.9
CAPNS1-216ENST00000628306 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-216ENST00000628306 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.38■■■■□ 3.89
CAPNS1-216ENST00000628306 REREQ9P2R6 1566 aa39.37■■■■□ 3.89
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA6Q8N139 1617 aa39.35■■■■□ 3.89
CAPNS1-216ENST00000628306 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.34■■■■□ 3.89
CAPNS1-216ENST00000628306 PREX2Q70Z35 1606 aa39.33■■■■□ 3.89
CAPNS1-216ENST00000628306 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.33■■■■□ 3.89
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.32■■■■□ 3.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC1P33527 1531 aa39.31■■■■□ 3.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CERKQ8TCT0 537 aa39.3■■■■□ 3.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.26■■■■□ 3.88
CAPNS1-216ENST00000628306 STRCQ7RTU9 1775 aa39.26■■■■□ 3.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-216ENST00000628306 AGLP35573 1532 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.2■■■■□ 3.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
CAPNS1-216ENST00000628306 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.19■■■■□ 3.86
CAPNS1-216ENST00000628306 C3P01024 1663 aa39.18■■■■□ 3.86
CAPNS1-216ENST00000628306 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-216ENST00000628306 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.15■■■■□ 3.86
CAPNS1-216ENST00000628306 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.12■■■■□ 3.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.08■■■■□ 3.85
CAPNS1-216ENST00000628306 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
CAPNS1-216ENST00000628306 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.02■■■■□ 3.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SYCP2Q9BX26 1530 aa39■■■■□ 3.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRTO14522 1441 aa38.98■■■■□ 3.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.97■■■■□ 3.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.91■■■■□ 3.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
CAPNS1-216ENST00000628306 MROH2AA6NES4 1674 aa38.9■■■■□ 3.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NCOA1Q15788 1441 aa38.89■■■■□ 3.82
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.89■■■■□ 3.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PLXNC1O60486 1568 aa38.88■■■■□ 3.81
CAPNS1-216ENST00000628306 LTBP4Q8N2S1 1624 aa38.87■■■■□ 3.81
CAPNS1-216ENST00000628306 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP7AQ04656 1500 aa38.86■■■■□ 3.81
CAPNS1-216ENST00000628306 NPATQ14207 1427 aa38.86■■■■□ 3.81
CAPNS1-216ENST00000628306 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYM3Q14202 1370 aa38.83■■■■□ 3.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.79■■■■□ 3.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
CAPNS1-216ENST00000628306 A2MP01023 1474 aa38.77■■■■□ 3.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
CAPNS1-216ENST00000628306 TIAM1Q13009 1591 aa38.7■■■■□ 3.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRKQ15262 1439 aa38.7■■■■□ 3.79
CAPNS1-216ENST00000628306 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.69■■■■□ 3.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MBD5Q9P267 1494 aa38.69■■■■□ 3.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
CAPNS1-216ENST00000628306 IQSEC2Q5JU85 1478 aa38.67■■■■□ 3.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.66■■■■□ 3.78
CAPNS1-216ENST00000628306 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.63■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.62■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ILDR2Q71H61 639 aa38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2R1Q13018 1463 aa38.59■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 GGT6Q6P531 493 aa38.59■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 DISP3Q9P2K9 1392 aa38.57■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP162Q5TB80 1403 aa38.57■■■■□ 3.77
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.55■■■■□ 3.76
CAPNS1-216ENST00000628306 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.55■■■■□ 3.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
CAPNS1-216ENST00000628306 PKD2Q13563 968 aa38.48■■■■□ 3.75
CAPNS1-216ENST00000628306 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
CAPNS1-216ENST00000628306 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.43■■■■□ 3.74
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.43■■■■□ 3.74
CAPNS1-216ENST00000628306 NCOA2Q15596 1464 aa38.4■■■■□ 3.74
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.39■■■■□ 3.74
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.38■■■■□ 3.73
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