RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626609.2

PCBP1-AS1-297, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 809 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.99□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 UBTFP17480 764 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MLECQ14165 292 aa13.99□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.97□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 HSPA2P54652 639 aa13.97□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.97□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.95□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 HECW1Q76N89 1606 aa13.95□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 FBXO41Q8TF61 875 aa13.95□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.95□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.94□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 PLCH2O75038 1416 aa13.93□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.93□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 KIF14Q15058 1648 aa13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.9□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 FMN1Q68DA7 1419 aa13.9□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.89□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.89□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.89□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.88□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 AFAP1Q8N556 730 aa13.87□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ATP10AO60312 1499 aa13.87□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.85□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.84□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.83□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CLIP1P30622 1438 aa13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.8□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CERKQ8TCT0 537 aa13.79□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 KDM5CP41229 1560 aa13.79□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.79□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ABCA6Q8N139 1617 aa13.77□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 PREX2Q70Z35 1606 aa13.75□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.75□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa13.74□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 STRCQ7RTU9 1775 aa13.74□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.74□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ABCC1P33527 1531 aa13.74□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.74□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.73□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 C3P01024 1663 aa13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CCDC18Q5T9S5 1454 aa13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.71□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 REREQ9P2R6 1566 aa13.71□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 13.9
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.68□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 AGLP35573 1532 aa13.68□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.67□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.67□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 FYCO1Q9BQS8 1478 aa13.67□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ZMYM3Q14202 1370 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MSH5O43196 834 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 PTPRTO14522 1441 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.6□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ATP7AQ04656 1500 aa13.6□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 GGT6Q6P531 493 aa13.6□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 NCOA1Q15788 1441 aa13.59□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.59□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.59□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.58□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.58□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MROH2AA6NES4 1674 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 A2MP01023 1474 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ILDR2Q71H61 639 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 PLXNC1O60486 1568 aa13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ZBTB22O15209 634 aa13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 NPATQ14207 1427 aa13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 TIAM1Q13009 1591 aa13.54□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.53□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 PTPRKQ15262 1439 aa13.53□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 MBD5Q9P267 1494 aa13.52□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.51□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-297ENST00000626609 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms