RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-215ENST00000596522 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-215ENST00000596522 RICTORQ6R327 1708 aa22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-215ENST00000596522 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.18■■□□□ 1.14
FCHO1-215ENST00000596522 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.18■■□□□ 1.14
FCHO1-215ENST00000596522 PREX2Q70Z35 1606 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-215ENST00000596522 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-215ENST00000596522 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FCHO1-215ENST00000596522 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FCHO1-215ENST00000596522 ADGRL1O94910 1474 aa22.15■■□□□ 1.14
FCHO1-215ENST00000596522 NCOA2Q15596 1464 aa22.13■■□□□ 1.13
FCHO1-215ENST00000596522 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FCHO1-215ENST00000596522 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.12■■□□□ 1.13
FCHO1-215ENST00000596522 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FCHO1-215ENST00000596522 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.1■■□□□ 1.13
FCHO1-215ENST00000596522 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-215ENST00000596522 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-215ENST00000596522 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.08■■□□□ 1.13
FCHO1-215ENST00000596522 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-215ENST00000596522 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.06■■□□□ 1.12
FCHO1-215ENST00000596522 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.06■■□□□ 1.12
FCHO1-215ENST00000596522 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.04■■□□□ 1.12
FCHO1-215ENST00000596522 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.03■■□□□ 1.12
FCHO1-215ENST00000596522 ABCC1P33527 1531 aa22.03■■□□□ 1.12
FCHO1-215ENST00000596522 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FCHO1-215ENST00000596522 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 MIA2Q96PC5 1412 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.99■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.98■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 AFAP1Q8N556 730 aa21.98■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 KDM5CP41229 1560 aa21.97■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-215ENST00000596522 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.93■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.91■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.9■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.89■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
FCHO1-215ENST00000596522 ATP10AO60312 1499 aa21.89■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.88■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.88■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 MBD5Q9P267 1494 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 ABCA6Q8N139 1617 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.85■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.85■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
FCHO1-215ENST00000596522 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.82■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 MADDQ8WXG6 1647 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 TSPY4P0CV99 314 aa21.8■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 TSPY10P0CW01 314 aa21.8■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 REREQ9P2R6 1566 aa21.79■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 ATP7AQ04656 1500 aa21.79■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 MLECQ14165 292 aa21.78■■□□□ 1.08
FCHO1-215ENST00000596522 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.76■■□□□ 1.07
FCHO1-215ENST00000596522 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.76■■□□□ 1.07
FCHO1-215ENST00000596522 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-215ENST00000596522 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.73■■□□□ 1.07
FCHO1-215ENST00000596522 PTPRMP28827 1452 aa21.73■■□□□ 1.07
FCHO1-215ENST00000596522 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.73■■□□□ 1.07
FCHO1-215ENST00000596522 AGLP35573 1532 aa21.71■■□□□ 1.07
FCHO1-215ENST00000596522 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
FCHO1-215ENST00000596522 DAPK1P53355 1430 aa21.7■■□□□ 1.06
FCHO1-215ENST00000596522 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-215ENST00000596522 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
FCHO1-215ENST00000596522 ABCC5O15440 1437 aa21.68■■□□□ 1.06
FCHO1-215ENST00000596522 A2MP01023 1474 aa21.68■■□□□ 1.06
FCHO1-215ENST00000596522 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
FCHO1-215ENST00000596522 PLXNC1O60486 1568 aa21.65■■□□□ 1.06
FCHO1-215ENST00000596522 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.64■■□□□ 1.05
FCHO1-215ENST00000596522 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-215ENST00000596522 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-215ENST00000596522 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.62■■□□□ 1.05
FCHO1-215ENST00000596522 ADGRL2O95490 1459 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-215ENST00000596522 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.58■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 KIF15Q9NS87 1388 aa21.58■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 C3P01024 1663 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 ERBINQ96RT1 1412 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 ROCK1Q13464 1354 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 GGT6Q6P531 493 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 NCOA1Q15788 1441 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms