RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591709.1

POLR2E-208, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 685 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-208ENST00000591709 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
POLR2E-208ENST00000591709 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.63■■■□□ 2.17
POLR2E-208ENST00000591709 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.6■■■□□ 2.17
POLR2E-208ENST00000591709 STRCQ7RTU9 1775 aa28.6■■■□□ 2.17
POLR2E-208ENST00000591709 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.55■■■□□ 2.16
POLR2E-208ENST00000591709 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.52■■■□□ 2.16
POLR2E-208ENST00000591709 ATP10AO60312 1499 aa28.51■■■□□ 2.15
POLR2E-208ENST00000591709 PLCH2O75038 1416 aa28.51■■■□□ 2.15
POLR2E-208ENST00000591709 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
POLR2E-208ENST00000591709 EEA1Q15075 1411 aa28.47■■■□□ 2.15
POLR2E-208ENST00000591709 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.47■■■□□ 2.15
POLR2E-208ENST00000591709 KIF14Q15058 1648 aa28.47■■■□□ 2.15
POLR2E-208ENST00000591709 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
POLR2E-208ENST00000591709 C3P01024 1663 aa28.43■■■□□ 2.14
POLR2E-208ENST00000591709 ILDR2Q71H61 639 aa28.42■■■□□ 2.14
POLR2E-208ENST00000591709 KDM5CP41229 1560 aa28.41■■■□□ 2.14
POLR2E-208ENST00000591709 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.41■■■□□ 2.14
POLR2E-208ENST00000591709 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.4■■■□□ 2.14
POLR2E-208ENST00000591709 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.4■■■□□ 2.14
POLR2E-208ENST00000591709 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.39■■■□□ 2.13
POLR2E-208ENST00000591709 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.38■■■□□ 2.13
POLR2E-208ENST00000591709 ABCA6Q8N139 1617 aa28.37■■■□□ 2.13
POLR2E-208ENST00000591709 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.37■■■□□ 2.13
POLR2E-208ENST00000591709 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.35■■■□□ 2.13
POLR2E-208ENST00000591709 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.34■■■□□ 2.13
POLR2E-208ENST00000591709 REREQ9P2R6 1566 aa28.33■■■□□ 2.12
POLR2E-208ENST00000591709 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.32■■■□□ 2.12
POLR2E-208ENST00000591709 SOCS7O14512 581 aa28.31■■■□□ 2.12
POLR2E-208ENST00000591709 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
POLR2E-208ENST00000591709 FMN1Q68DA7 1419 aa28.27■■■□□ 2.12
POLR2E-208ENST00000591709 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.27■■■□□ 2.12
POLR2E-208ENST00000591709 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.26■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 PTPRTO14522 1441 aa28.26■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 AFAP1Q8N556 730 aa28.25■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 PREX2Q70Z35 1606 aa28.25■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.24■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.21■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 ABCC1P33527 1531 aa28.21■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.21■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 CLIP1P30622 1438 aa28.2■■■□□ 2.11
POLR2E-208ENST00000591709 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
POLR2E-208ENST00000591709 AGLP35573 1532 aa28.19■■■□□ 2.1
POLR2E-208ENST00000591709 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.19■■■□□ 2.1
POLR2E-208ENST00000591709 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.17■■■□□ 2.1
POLR2E-208ENST00000591709 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.16■■■□□ 2.1
POLR2E-208ENST00000591709 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
POLR2E-208ENST00000591709 MROH2AA6NES4 1674 aa28.15■■■□□ 2.1
POLR2E-208ENST00000591709 NCOA1Q15788 1441 aa28.15■■■□□ 2.1
POLR2E-208ENST00000591709 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.15■■■□□ 2.1
POLR2E-208ENST00000591709 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.13■■■□□ 2.09
POLR2E-208ENST00000591709 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
POLR2E-208ENST00000591709 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.11■■■□□ 2.09
POLR2E-208ENST00000591709 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
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POLR2E-208ENST00000591709 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
POLR2E-208ENST00000591709 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
POLR2E-208ENST00000591709 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.04■■■□□ 2.08
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POLR2E-208ENST00000591709 NPATQ14207 1427 aa28■■■□□ 2.07
POLR2E-208ENST00000591709 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.98■■■□□ 2.07
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POLR2E-208ENST00000591709 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
POLR2E-208ENST00000591709 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
POLR2E-208ENST00000591709 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.92■■■□□ 2.06
POLR2E-208ENST00000591709 PLXNC1O60486 1568 aa27.91■■■□□ 2.06
POLR2E-208ENST00000591709 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
POLR2E-208ENST00000591709 ZMYM3Q14202 1370 aa27.91■■■□□ 2.06
POLR2E-208ENST00000591709 ATP7AQ04656 1500 aa27.91■■■□□ 2.06
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POLR2E-208ENST00000591709 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
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POLR2E-208ENST00000591709 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
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POLR2E-208ENST00000591709 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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POLR2E-208ENST00000591709 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.73■■■□□ 2.03
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POLR2E-208ENST00000591709 GGT6Q6P531 493 aa27.71■■■□□ 2.03
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POLR2E-208ENST00000591709 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
POLR2E-208ENST00000591709 CPS1P31327 1500 aa27.65■■■□□ 2.02
POLR2E-208ENST00000591709 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
POLR2E-208ENST00000591709 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.63■■■□□ 2.01
POLR2E-208ENST00000591709 HSPA1LP34931 641 aa27.63■■■□□ 2.01
POLR2E-208ENST00000591709 TIAM1Q13009 1591 aa27.62■■■□□ 2.01
POLR2E-208ENST00000591709 PIP4K2BP78356 416 aa27.62■■■□□ 2.01
POLR2E-208ENST00000591709 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.58■■■□□ 2.01
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