RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-205ENST00000588780 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 PLCH2O75038 1416 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP10AO60312 1499 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 EEA1Q15075 1411 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-205ENST00000588780 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-205ENST00000588780 ILDR2Q71H61 639 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-205ENST00000588780 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-205ENST00000588780 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-205ENST00000588780 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-205ENST00000588780 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.32■■■■□ 3.4
CAPNS1-205ENST00000588780 AFAP1Q8N556 730 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-205ENST00000588780 SOCS7O14512 581 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-205ENST00000588780 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-205ENST00000588780 STRCQ7RTU9 1775 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-205ENST00000588780 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-205ENST00000588780 FMN1Q68DA7 1419 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-205ENST00000588780 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF14Q15058 1648 aa36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-205ENST00000588780 CLIP1P30622 1438 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-205ENST00000588780 PTPRTO14522 1441 aa36.13■■■■□ 3.37
CAPNS1-205ENST00000588780 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
CAPNS1-205ENST00000588780 KDM5CP41229 1560 aa36.13■■■■□ 3.37
CAPNS1-205ENST00000588780 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.12■■■■□ 3.37
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-205ENST00000588780 C3P01024 1663 aa36.07■■■■□ 3.37
CAPNS1-205ENST00000588780 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCA6Q8N139 1617 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-205ENST00000588780 REREQ9P2R6 1566 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-205ENST00000588780 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-205ENST00000588780 AGLP35573 1532 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-205ENST00000588780 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-205ENST00000588780 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-205ENST00000588780 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-205ENST00000588780 NCOA1Q15788 1441 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCC1P33527 1531 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-205ENST00000588780 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-205ENST00000588780 PREX2Q70Z35 1606 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-205ENST00000588780 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-205ENST00000588780 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-205ENST00000588780 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-205ENST00000588780 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-205ENST00000588780 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-205ENST00000588780 ZMYM3Q14202 1370 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-205ENST00000588780 NPATQ14207 1427 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-205ENST00000588780 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
CAPNS1-205ENST00000588780 MROH2AA6NES4 1674 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-205ENST00000588780 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-205ENST00000588780 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-205ENST00000588780 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-205ENST00000588780 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-205ENST00000588780 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-205ENST00000588780 PKD2Q13563 968 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-205ENST00000588780 GGT6Q6P531 493 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-205ENST00000588780 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-205ENST00000588780 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-205ENST00000588780 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-205ENST00000588780 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-205ENST00000588780 PLA2R1Q13018 1463 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP7AQ04656 1500 aa35.57■■■■□ 3.29
CAPNS1-205ENST00000588780 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-205ENST00000588780 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-205ENST00000588780 A2MP01023 1474 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-205ENST00000588780 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-205ENST00000588780 PTPRKQ15262 1439 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-205ENST00000588780 PIP4K2BP78356 416 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-205ENST00000588780 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-205ENST00000588780 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-205ENST00000588780 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-205ENST00000588780 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-205ENST00000588780 PLXNC1O60486 1568 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-205ENST00000588780 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-205ENST00000588780 HSPA1LP34931 641 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-205ENST00000588780 TOM1O60784 492 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-205ENST00000588780 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-205ENST00000588780 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-205ENST00000588780 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-205ENST00000588780 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-205ENST00000588780 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-205ENST00000588780 TNRQ92752 1358 aa35.3■■■■□ 3.24
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