RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583486.1

GPS1-218, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPS1, Length 796 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-218ENST00000583486 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.98■■□□□ 1.59
GPS1-218ENST00000583486 HECW1Q76N89 1606 aa24.97■■□□□ 1.59
GPS1-218ENST00000583486 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.95■■□□□ 1.58
GPS1-218ENST00000583486 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GPS1-218ENST00000583486 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.94■■□□□ 1.58
GPS1-218ENST00000583486 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.94■■□□□ 1.58
GPS1-218ENST00000583486 ATP10AO60312 1499 aa24.93■■□□□ 1.58
GPS1-218ENST00000583486 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.91■■□□□ 1.58
GPS1-218ENST00000583486 PLCH2O75038 1416 aa24.88■■□□□ 1.57
GPS1-218ENST00000583486 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.88■■□□□ 1.57
GPS1-218ENST00000583486 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GPS1-218ENST00000583486 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.88■■□□□ 1.57
GPS1-218ENST00000583486 STRCQ7RTU9 1775 aa24.86■■□□□ 1.57
GPS1-218ENST00000583486 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.82■■□□□ 1.56
GPS1-218ENST00000583486 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GPS1-218ENST00000583486 PTPRTO14522 1441 aa24.8■■□□□ 1.56
GPS1-218ENST00000583486 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
GPS1-218ENST00000583486 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.77■■□□□ 1.56
GPS1-218ENST00000583486 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.74■■□□□ 1.55
GPS1-218ENST00000583486 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.74■■□□□ 1.55
GPS1-218ENST00000583486 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.73■■□□□ 1.55
GPS1-218ENST00000583486 EEA1Q15075 1411 aa24.73■■□□□ 1.55
GPS1-218ENST00000583486 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GPS1-218ENST00000583486 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GPS1-218ENST00000583486 KDM5CP41229 1560 aa24.69■■□□□ 1.54
GPS1-218ENST00000583486 AFAP1Q8N556 730 aa24.69■■□□□ 1.54
GPS1-218ENST00000583486 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
GPS1-218ENST00000583486 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.68■■□□□ 1.54
GPS1-218ENST00000583486 REREQ9P2R6 1566 aa24.67■■□□□ 1.54
GPS1-218ENST00000583486 C3P01024 1663 aa24.66■■□□□ 1.54
GPS1-218ENST00000583486 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.66■■□□□ 1.54
GPS1-218ENST00000583486 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.66■■□□□ 1.54
GPS1-218ENST00000583486 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.65■■□□□ 1.54
GPS1-218ENST00000583486 KIF14Q15058 1648 aa24.64■■□□□ 1.53
GPS1-218ENST00000583486 NCOA1Q15788 1441 aa24.62■■□□□ 1.53
GPS1-218ENST00000583486 FMN1Q68DA7 1419 aa24.62■■□□□ 1.53
GPS1-218ENST00000583486 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.6■■□□□ 1.53
GPS1-218ENST00000583486 AGLP35573 1532 aa24.6■■□□□ 1.53
GPS1-218ENST00000583486 CLIP1P30622 1438 aa24.6■■□□□ 1.53
GPS1-218ENST00000583486 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.59■■□□□ 1.53
GPS1-218ENST00000583486 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
GPS1-218ENST00000583486 ABCA6Q8N139 1617 aa24.57■■□□□ 1.52
GPS1-218ENST00000583486 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.53■■□□□ 1.52
GPS1-218ENST00000583486 NPATQ14207 1427 aa24.52■■□□□ 1.52
GPS1-218ENST00000583486 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.52■■□□□ 1.52
GPS1-218ENST00000583486 ABCC1P33527 1531 aa24.47■■□□□ 1.51
GPS1-218ENST00000583486 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
GPS1-218ENST00000583486 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.47■■□□□ 1.51
GPS1-218ENST00000583486 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.45■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 MROH2AA6NES4 1674 aa24.44■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 PREX2Q70Z35 1606 aa24.43■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 PKD2Q13563 968 aa24.43■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.43■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 ZMYM3Q14202 1370 aa24.42■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.42■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.42■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 PLA2R1Q13018 1463 aa24.4■■□□□ 1.5
GPS1-218ENST00000583486 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GPS1-218ENST00000583486 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.35■■□□□ 1.49
GPS1-218ENST00000583486 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GPS1-218ENST00000583486 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.34■■□□□ 1.49
GPS1-218ENST00000583486 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.33■■□□□ 1.49
GPS1-218ENST00000583486 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.33■■□□□ 1.49
GPS1-218ENST00000583486 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.33■■□□□ 1.49
GPS1-218ENST00000583486 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.33■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.32■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 PTPRKQ15262 1439 aa24.28■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.28■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 HSPA1LP34931 641 aa24.28■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 TOM1O60784 492 aa24.27■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 PIP4K2BP78356 416 aa24.27■■□□□ 1.48
GPS1-218ENST00000583486 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.25■■□□□ 1.47
GPS1-218ENST00000583486 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.24■■□□□ 1.47
GPS1-218ENST00000583486 ATP7AQ04656 1500 aa24.24■■□□□ 1.47
GPS1-218ENST00000583486 GGT6Q6P531 493 aa24.23■■□□□ 1.47
GPS1-218ENST00000583486 A2MP01023 1474 aa24.23■■□□□ 1.47
GPS1-218ENST00000583486 PLXNC1O60486 1568 aa24.23■■□□□ 1.47
GPS1-218ENST00000583486 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
GPS1-218ENST00000583486 CPS1P31327 1500 aa24.21■■□□□ 1.47
GPS1-218ENST00000583486 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.2■■□□□ 1.47
GPS1-218ENST00000583486 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
GPS1-218ENST00000583486 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.19■■□□□ 1.46
GPS1-218ENST00000583486 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.18■■□□□ 1.46
GPS1-218ENST00000583486 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
GPS1-218ENST00000583486 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GPS1-218ENST00000583486 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GPS1-218ENST00000583486 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.15■■□□□ 1.46
GPS1-218ENST00000583486 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
GPS1-218ENST00000583486 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GPS1-218ENST00000583486 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.12■■□□□ 1.45
GPS1-218ENST00000583486 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.1■■□□□ 1.45
GPS1-218ENST00000583486 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms