RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580022.5

TSPOAP1-AS1-205, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,337 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KDM6BO15054 1643 aa34.86■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.85■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ABCC5O15440 1437 aa34.84■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.83■■■■□ 3.17
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.8■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.8■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SHROOM2Q13796 1616 aa34.79■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRIM52Q96A61 297 aa34.78■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ROCK1Q13464 1354 aa34.75■■■■□ 3.15
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.7■■■■□ 3.15
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TONSLQ96HA7 1378 aa34.7■■■■□ 3.14
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.68■■■■□ 3.14
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.68■■■■□ 3.14
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.61■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.58■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.58■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.57■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NCOA1Q15788 1441 aa34.54■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FOXD1Q16676 465 aa34.51■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ABCC2Q92887 1545 aa34.5■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ADGRL2O95490 1459 aa34.5■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.45■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.45■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.41■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PREX2Q70Z35 1606 aa34.4■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.4■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.39■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.37■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.36■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.34■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PZPP20742 1482 aa34.34■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TSPY4P0CV99 314 aa34.34■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TSPY10P0CW01 314 aa34.34■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.34■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.34■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.32■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MBD5Q9P267 1494 aa34.32■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KCNH8Q96L42 1107 aa34.3■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.28■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.26■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MYT1Q01538 1121 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.23■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.22■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KIF15Q9NS87 1388 aa34.22■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.16■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PKD2Q13563 968 aa34.16■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NUP155O75694 1391 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PLCH2O75038 1416 aa34.07■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.05■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.05■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.04■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.03■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.02■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.99■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.98■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PLXNC1O60486 1568 aa33.93■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.93■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ABCC1P33527 1531 aa33.92■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 OSCARQ8IYS5 282 aa33.92■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.91■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.87■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.87■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ANP32CO43423 234 aa33.86■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 UNC13BO14795 1591 aa33.85■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.83■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.82■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ASXL2Q76L83 1435 aa33.78■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.76■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 AFAP1Q8N556 730 aa33.75■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ERBINQ96RT1 1412 aa33.75■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.74■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FANCAO15360 1455 aa33.74■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.72■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCER2I3L3R5 266 aa33.69■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCDC7Q96M83 1385 aa33.68■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.68■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.67■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.67■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms