RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568206.1

HERC2-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 2

Gene HERC2, Length 2,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-210ENST00000568206 ABCC5O15440 1437 aa28.34■■■□□ 2.13
HERC2-210ENST00000568206 MAPKBP1O60336 1514 aa28.33■■■□□ 2.13
HERC2-210ENST00000568206 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
HERC2-210ENST00000568206 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
HERC2-210ENST00000568206 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.3■■■□□ 2.12
HERC2-210ENST00000568206 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.27■■■□□ 2.12
HERC2-210ENST00000568206 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
HERC2-210ENST00000568206 PREX2Q70Z35 1606 aa28.26■■■□□ 2.11
HERC2-210ENST00000568206 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
HERC2-210ENST00000568206 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.24■■■□□ 2.11
HERC2-210ENST00000568206 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
HERC2-210ENST00000568206 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.21■■■□□ 2.11
HERC2-210ENST00000568206 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.2■■■□□ 2.11
HERC2-210ENST00000568206 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.2■■■□□ 2.1
HERC2-210ENST00000568206 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
HERC2-210ENST00000568206 ADGRL2O95490 1459 aa28.19■■■□□ 2.1
HERC2-210ENST00000568206 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.18■■■□□ 2.1
HERC2-210ENST00000568206 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.16■■■□□ 2.1
HERC2-210ENST00000568206 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.16■■■□□ 2.1
HERC2-210ENST00000568206 NCOA1Q15788 1441 aa28.13■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.13■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 KDM6BO15054 1643 aa28.12■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.12■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.12■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.11■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 KCNH8Q96L42 1107 aa28.1■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.08■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 MBD5Q9P267 1494 aa28.08■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.08■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.08■■■□□ 2.09
HERC2-210ENST00000568206 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.07■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 TSPY4P0CV99 314 aa28.06■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 TSPY10P0CW01 314 aa28.06■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.06■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 PLCH2O75038 1416 aa28.06■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 TRIM52Q96A61 297 aa28.05■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.04■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.02■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.08
HERC2-210ENST00000568206 SYCP2Q9BX26 1530 aa28■■■□□ 2.07
HERC2-210ENST00000568206 SIN3AQ96ST3 1273 aa28■■■□□ 2.07
HERC2-210ENST00000568206 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.98■■■□□ 2.07
HERC2-210ENST00000568206 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.07
HERC2-210ENST00000568206 NEUROD1Q13562 356 aa27.97■■■□□ 2.07
HERC2-210ENST00000568206 ASXL2Q76L83 1435 aa27.96■■■□□ 2.07
HERC2-210ENST00000568206 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.96■■■□□ 2.07
HERC2-210ENST00000568206 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.96■■■□□ 2.07
HERC2-210ENST00000568206 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.96■■■□□ 2.07
HERC2-210ENST00000568206 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.94■■■□□ 2.06
HERC2-210ENST00000568206 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
HERC2-210ENST00000568206 KIF15Q9NS87 1388 aa27.91■■■□□ 2.06
HERC2-210ENST00000568206 ABCC1P33527 1531 aa27.9■■■□□ 2.06
HERC2-210ENST00000568206 TONSLQ96HA7 1378 aa27.88■■■□□ 2.05
HERC2-210ENST00000568206 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.85■■■□□ 2.05
HERC2-210ENST00000568206 PLXNC1O60486 1568 aa27.85■■■□□ 2.05
HERC2-210ENST00000568206 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
HERC2-210ENST00000568206 PZPP20742 1482 aa27.84■■■□□ 2.05
HERC2-210ENST00000568206 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
HERC2-210ENST00000568206 FANCAO15360 1455 aa27.8■■■□□ 2.04
HERC2-210ENST00000568206 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.8■■■□□ 2.04
HERC2-210ENST00000568206 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
HERC2-210ENST00000568206 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.78■■■□□ 2.04
HERC2-210ENST00000568206 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.75■■■□□ 2.03
HERC2-210ENST00000568206 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.74■■■□□ 2.03
HERC2-210ENST00000568206 NUP155O75694 1391 aa27.73■■■□□ 2.03
HERC2-210ENST00000568206 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.73■■■□□ 2.03
HERC2-210ENST00000568206 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.73■■■□□ 2.03
HERC2-210ENST00000568206 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.73■■■□□ 2.03
HERC2-210ENST00000568206 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.73■■■□□ 2.03
HERC2-210ENST00000568206 FOXD1Q16676 465 aa27.7■■■□□ 2.03
HERC2-210ENST00000568206 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
HERC2-210ENST00000568206 ERBINQ96RT1 1412 aa27.69■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.69■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 ADGRL1O94910 1474 aa27.69■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 UNC13BO14795 1591 aa27.67■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 CD109Q6YHK3 1445 aa27.66■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.66■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 PKD2Q13563 968 aa27.65■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.64■■■□□ 2.02
HERC2-210ENST00000568206 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.64■■■□□ 2.01
HERC2-210ENST00000568206 AFAP1Q8N556 730 aa27.62■■■□□ 2.01
HERC2-210ENST00000568206 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.62■■■□□ 2.01
HERC2-210ENST00000568206 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
HERC2-210ENST00000568206 ATP7AQ04656 1500 aa27.59■■■□□ 2.01
HERC2-210ENST00000568206 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.58■■■□□ 2.01
HERC2-210ENST00000568206 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.56■■■□□ 2
HERC2-210ENST00000568206 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.56■■■□□ 2
HERC2-210ENST00000568206 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.55■■■□□ 2
HERC2-210ENST00000568206 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.53■■■□□ 2
HERC2-210ENST00000568206 NEO1Q92859 1461 aa27.52■■■□□ 2
HERC2-210ENST00000568206 GLI2P10070 1586 aa27.51■■■□□ 2
HERC2-210ENST00000568206 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.48■■□□□ 1.99
HERC2-210ENST00000568206 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.47■■□□□ 1.99
HERC2-210ENST00000568206 KDM5CP41229 1560 aa27.47■■□□□ 1.99
HERC2-210ENST00000568206 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
HERC2-210ENST00000568206 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
HERC2-210ENST00000568206 DEPDC5O75140 1603 aa27.44■■□□□ 1.98
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