RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.6■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.58■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.57■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FMN1Q68DA7 1419 aa15.57■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLCH2O75038 1416 aa15.56■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.56■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.56■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HECW1Q76N89 1606 aa15.55■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.54■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.53■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.52■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.52■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.52■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.51■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.51■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.51■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FBXO41Q8TF61 875 aa15.5■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.5■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIF14Q15058 1648 aa15.47■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.47■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATP10AO60312 1499 aa15.46■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MLECQ14165 292 aa15.46■□□□□ 0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CLIP1P30622 1438 aa15.45■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.44■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.44■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.44■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.43■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HSPA2P54652 639 aa15.42■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.42■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.4■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KDM5CP41229 1560 aa15.4■□□□□ 0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AFAP1Q8N556 730 aa15.39■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.39■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.38■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.38■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.38■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.37■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PREX2Q70Z35 1606 aa15.36■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 REREQ9P2R6 1566 aa15.36■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.35■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.35■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCC1P33527 1531 aa15.33■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.32■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.32■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCA6Q8N139 1617 aa15.32■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.31■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.31■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AGLP35573 1532 aa15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CERKQ8TCT0 537 aa15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C3P01024 1663 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 STRCQ7RTU9 1775 aa15.26■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.23■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.21■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MROH2AA6NES4 1674 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 41.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTPRTO14522 1441 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATP7AQ04656 1500 aa15.17■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.17■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NPATQ14207 1427 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZMYM3Q14202 1370 aa15.15■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A2MP01023 1474 aa15.14■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLXNC1O60486 1568 aa15.13■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.12■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NCOA1Q15788 1441 aa15.12■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.11■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TIAM1Q13009 1591 aa15.11■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.1■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GGT6Q6P531 493 aa15.1■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.09■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.09■□□□□ 0.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CEP162Q5TB80 1403 aa15.08■□□□□ 0
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.08■□□□□ 0
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MBD5Q9P267 1494 aa15.08■□□□□ 0
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
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