RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533683.6

SAMD1-202, Transcript of sterile alpha motif domain containing 1, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD1, Length 2,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1-202ENST00000533683 KDM6BO15054 1643 aa41.24■■■■■ 4.19
SAMD1-202ENST00000533683 ROCK1Q13464 1354 aa41.24■■■■■ 4.19
SAMD1-202ENST00000533683 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.23■■■■■ 4.19
SAMD1-202ENST00000533683 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.18■■■■■ 4.18
SAMD1-202ENST00000533683 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.18■■■■■ 4.18
SAMD1-202ENST00000533683 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.13■■■■■ 4.18
SAMD1-202ENST00000533683 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.12■■■■■ 4.17
SAMD1-202ENST00000533683 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
SAMD1-202ENST00000533683 TRIM52Q96A61 297 aa41.09■■■■■ 4.17
SAMD1-202ENST00000533683 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
SAMD1-202ENST00000533683 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
SAMD1-202ENST00000533683 MIER1Q8N108 512 aa41.02■■■■■ 4.16
SAMD1-202ENST00000533683 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.99■■■■■ 4.15
SAMD1-202ENST00000533683 TONSLQ96HA7 1378 aa40.99■■■■■ 4.15
SAMD1-202ENST00000533683 ABCC2Q92887 1545 aa40.99■■■■■ 4.15
SAMD1-202ENST00000533683 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
SAMD1-202ENST00000533683 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.97■■■■■ 4.15
SAMD1-202ENST00000533683 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.96■■■■■ 4.15
SAMD1-202ENST00000533683 NCOA1Q15788 1441 aa40.96■■■■■ 4.15
SAMD1-202ENST00000533683 ADGRL2O95490 1459 aa40.94■■■■■ 4.14
SAMD1-202ENST00000533683 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.83■■■■■ 4.13
SAMD1-202ENST00000533683 PREX2Q70Z35 1606 aa40.82■■■■■ 4.13
SAMD1-202ENST00000533683 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.82■■■■■ 4.13
SAMD1-202ENST00000533683 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.81■■■■■ 4.12
SAMD1-202ENST00000533683 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.78■■■■■ 4.12
SAMD1-202ENST00000533683 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.78■■■■■ 4.12
SAMD1-202ENST00000533683 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.76■■■■■ 4.12
SAMD1-202ENST00000533683 FOXD1Q16676 465 aa40.76■■■■■ 4.12
SAMD1-202ENST00000533683 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.75■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.75■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.111e-7■■□□□ 11.8
SAMD1-202ENST00000533683 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.74■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 MBD5Q9P267 1494 aa40.74■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.73■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.7■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 TSPY4P0CV99 314 aa40.69■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 TSPY10P0CW01 314 aa40.69■■■■■ 4.11
SAMD1-202ENST00000533683 PZPP20742 1482 aa40.69■■■■■ 4.1
SAMD1-202ENST00000533683 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.68■■■■■ 4.1
SAMD1-202ENST00000533683 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.63■■■■■ 4.09
SAMD1-202ENST00000533683 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.62■■■■■ 4.09
SAMD1-202ENST00000533683 KCNH8Q96L42 1107 aa40.61■■■■■ 4.09
SAMD1-202ENST00000533683 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.6■■■■■ 4.09
SAMD1-202ENST00000533683 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
SAMD1-202ENST00000533683 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.58■■■■■ 4.09
SAMD1-202ENST00000533683 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
SAMD1-202ENST00000533683 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.55■■■■■ 4.08
SAMD1-202ENST00000533683 KIF15Q9NS87 1388 aa40.55■■■■■ 4.08
SAMD1-202ENST00000533683 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
SAMD1-202ENST00000533683 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.51■■■■■ 4.08
SAMD1-202ENST00000533683 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
SAMD1-202ENST00000533683 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.48■■■■■ 4.07
SAMD1-202ENST00000533683 PLCH2O75038 1416 aa40.46■■■■■ 4.07
SAMD1-202ENST00000533683 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.45■■■■■ 4.07
SAMD1-202ENST00000533683 NUP155O75694 1391 aa40.43■■■■■ 4.06
SAMD1-202ENST00000533683 PKD2Q13563 968 aa40.43■■■■■ 4.06
SAMD1-202ENST00000533683 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.43■■■■■ 4.06
SAMD1-202ENST00000533683 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.42■■■■■ 4.06
SAMD1-202ENST00000533683 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
SAMD1-202ENST00000533683 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.41■■■■■ 4.06
SAMD1-202ENST00000533683 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
SAMD1-202ENST00000533683 OSCARQ8IYS5 282 aa40.36■■■■■ 4.05
SAMD1-202ENST00000533683 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.36■■■■■ 4.05
SAMD1-202ENST00000533683 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.34■■■■■ 4.05
SAMD1-202ENST00000533683 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.3■■■■■ 4.04
SAMD1-202ENST00000533683 PLXNC1O60486 1568 aa40.27■■■■■ 4.04
SAMD1-202ENST00000533683 ABCC1P33527 1531 aa40.26■■■■■ 4.04
SAMD1-202ENST00000533683 NBPF8Q3BBV2 869 aa40.24■■■■■ 4.03
SAMD1-202ENST00000533683 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.23■■■■■ 4.03
SAMD1-202ENST00000533683 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
SAMD1-202ENST00000533683 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.18■■■■■ 4.02
SAMD1-202ENST00000533683 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP40.18■■■■■ 4.02
SAMD1-202ENST00000533683 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.17■■■■■ 4.02
SAMD1-202ENST00000533683 UNC13BO14795 1591 aa40.15■■■■■ 4.02
SAMD1-202ENST00000533683 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.13■■■■■ 4.02
SAMD1-202ENST00000533683 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.12■■■■■ 4.01
SAMD1-202ENST00000533683 ASXL2Q76L83 1435 aa40.11■■■■■ 4.01
SAMD1-202ENST00000533683 ERBINQ96RT1 1412 aa40.05■■■■■ 4
SAMD1-202ENST00000533683 FANCAO15360 1455 aa40.03■■■■■ 4
SAMD1-202ENST00000533683 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.02■■■■■ 4
SAMD1-202ENST00000533683 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.01■■■■■ 41e-6■■■□□ 17.6
SAMD1-202ENST00000533683 AFAP1Q8N556 730 aa40■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.98■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa39.98■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.97■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.97■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.96■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 ANP32CO43423 234 aa39.95■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.95■■■■□ 3.99
SAMD1-202ENST00000533683 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.91■■■■□ 3.98
SAMD1-202ENST00000533683 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
SAMD1-202ENST00000533683 ADGRL1O94910 1474 aa39.87■■■■□ 3.97
SAMD1-202ENST00000533683 PLA2R1Q13018 1463 aa39.87■■■■□ 3.97
SAMD1-202ENST00000533683 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
SAMD1-202ENST00000533683 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.85■■■■□ 3.97
SAMD1-202ENST00000533683 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.85■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms