RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533080.5

TSPAN18-211, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN18, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-211ENST00000533080 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.43■■■□□ 2.78
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TSPAN18-211ENST00000533080 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.4■■■□□ 2.78
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TSPAN18-211ENST00000533080 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.08■■■□□ 2.73
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TSPAN18-211ENST00000533080 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.07■■■□□ 2.72
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TSPAN18-211ENST00000533080 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.01■■■□□ 2.72
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TSPAN18-211ENST00000533080 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPAN18-211ENST00000533080 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.93■■■□□ 2.7
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TSPAN18-211ENST00000533080 ABCC1P33527 1531 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPAN18-211ENST00000533080 PREX2Q70Z35 1606 aa31.92■■■□□ 2.7
TSPAN18-211ENST00000533080 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.91■■■□□ 2.7
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TSPAN18-211ENST00000533080 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.64■■■□□ 2.66
TSPAN18-211ENST00000533080 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.64■■■□□ 2.66
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TSPAN18-211ENST00000533080 CPS1P31327 1500 aa31.36■■■□□ 2.61
TSPAN18-211ENST00000533080 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
TSPAN18-211ENST00000533080 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
TSPAN18-211ENST00000533080 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
TSPAN18-211ENST00000533080 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.34■■■□□ 2.61
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TSPAN18-211ENST00000533080 MBD5Q9P267 1494 aa31.31■■■□□ 2.6
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