RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530500.5

ATG13-216, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-216ENST00000530500 ABCA8O94911 1581 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG13-216ENST00000530500 KDM6BO15054 1643 aa23■■□□□ 1.27
ATG13-216ENST00000530500 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ATG13-216ENST00000530500 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ATG13-216ENST00000530500 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG13-216ENST00000530500 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG13-216ENST00000530500 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG13-216ENST00000530500 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG13-216ENST00000530500 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG13-216ENST00000530500 KIF14Q15058 1648 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG13-216ENST00000530500 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ATG13-216ENST00000530500 ATP10BO94823 1461 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG13-216ENST00000530500 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG13-216ENST00000530500 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG13-216ENST00000530500 PTPRGP23470 1445 aa22.89■■□□□ 1.26
ATG13-216ENST00000530500 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
ATG13-216ENST00000530500 ADGRL2O95490 1459 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG13-216ENST00000530500 NCOA1Q15788 1441 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG13-216ENST00000530500 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG13-216ENST00000530500 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG13-216ENST00000530500 CHD1O14646 1710 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG13-216ENST00000530500 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG13-216ENST00000530500 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ATG13-216ENST00000530500 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.83■■□□□ 1.25
ATG13-216ENST00000530500 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.83■■□□□ 1.25
ATG13-216ENST00000530500 SHROOM2Q13796 1616 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG13-216ENST00000530500 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ATG13-216ENST00000530500 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ATG13-216ENST00000530500 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG13-216ENST00000530500 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ATG13-216ENST00000530500 FOXD1Q16676 465 aa22.75■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.75■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 PZPP20742 1482 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 ANP32CO43423 234 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 CCER2I3L3R5 266 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 TSPY4P0CV99 314 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 TSPY10P0CW01 314 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.23
ATG13-216ENST00000530500 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG13-216ENST00000530500 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG13-216ENST00000530500 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG13-216ENST00000530500 PREX2Q70Z35 1606 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG13-216ENST00000530500 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ATG13-216ENST00000530500 ABCC2Q92887 1545 aa22.65■■□□□ 1.22
ATG13-216ENST00000530500 MBD5Q9P267 1494 aa22.65■■□□□ 1.22
ATG13-216ENST00000530500 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.65■■□□□ 1.22
ATG13-216ENST00000530500 KCNH8Q96L42 1107 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 PKD2Q13563 968 aa22.6■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 KIF15Q9NS87 1388 aa22.59■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 NUP155O75694 1391 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG13-216ENST00000530500 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG13-216ENST00000530500 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG13-216ENST00000530500 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
ATG13-216ENST00000530500 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG13-216ENST00000530500 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG13-216ENST00000530500 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG13-216ENST00000530500 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG13-216ENST00000530500 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG13-216ENST00000530500 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG13-216ENST00000530500 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG13-216ENST00000530500 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG13-216ENST00000530500 CCDC7Q96M83 1385 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG13-216ENST00000530500 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG13-216ENST00000530500 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ATG13-216ENST00000530500 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ATG13-216ENST00000530500 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG13-216ENST00000530500 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG13-216ENST00000530500 PLCH2O75038 1416 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG13-216ENST00000530500 PLXNC1O60486 1568 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG13-216ENST00000530500 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG13-216ENST00000530500 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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ATG13-216ENST00000530500 UNC13BO14795 1591 aa22.4■■□□□ 1.18
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ATG13-216ENST00000530500 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG13-216ENST00000530500 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG13-216ENST00000530500 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG13-216ENST00000530500 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG13-216ENST00000530500 USP47Q96K76 1375 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG13-216ENST00000530500 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG13-216ENST00000530500 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG13-216ENST00000530500 ERBINQ96RT1 1412 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG13-216ENST00000530500 KDM5CP41229 1560 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG13-216ENST00000530500 ABCC1P33527 1531 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG13-216ENST00000530500 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG13-216ENST00000530500 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG13-216ENST00000530500 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG13-216ENST00000530500 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG13-216ENST00000530500 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG13-216ENST00000530500 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG13-216ENST00000530500 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.26■■□□□ 1.15
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