RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528966.5

LTBP3-211, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP3, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3-211ENST00000528966 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.23■■■□□ 2.43
LTBP3-211ENST00000528966 ILDR2Q71H61 639 aa30.22■■■□□ 2.43
LTBP3-211ENST00000528966 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.19■■■□□ 2.42
LTBP3-211ENST00000528966 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.18■■■□□ 2.42
LTBP3-211ENST00000528966 STRCQ7RTU9 1775 aa30.18■■■□□ 2.42
LTBP3-211ENST00000528966 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
LTBP3-211ENST00000528966 PLCH2O75038 1416 aa30.15■■■□□ 2.42
LTBP3-211ENST00000528966 ATP10AO60312 1499 aa30.15■■■□□ 2.42
LTBP3-211ENST00000528966 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.13■■■□□ 2.41
LTBP3-211ENST00000528966 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
LTBP3-211ENST00000528966 SOCS7O14512 581 aa30.11■■■□□ 2.41
LTBP3-211ENST00000528966 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.05■■■□□ 2.4
LTBP3-211ENST00000528966 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
LTBP3-211ENST00000528966 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.04■■■□□ 2.4
LTBP3-211ENST00000528966 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.03■■■□□ 2.4
LTBP3-211ENST00000528966 EEA1Q15075 1411 aa30■■■□□ 2.39
LTBP3-211ENST00000528966 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.99■■■□□ 2.39
LTBP3-211ENST00000528966 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.99■■■□□ 2.39
LTBP3-211ENST00000528966 KDM5CP41229 1560 aa29.98■■■□□ 2.39
LTBP3-211ENST00000528966 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.97■■■□□ 2.39
LTBP3-211ENST00000528966 KIF14Q15058 1648 aa29.95■■■□□ 2.38
LTBP3-211ENST00000528966 PTPRTO14522 1441 aa29.94■■■□□ 2.38
LTBP3-211ENST00000528966 C3P01024 1663 aa29.94■■■□□ 2.38
LTBP3-211ENST00000528966 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.94■■■□□ 2.38
LTBP3-211ENST00000528966 AFAP1Q8N556 730 aa29.92■■■□□ 2.38
LTBP3-211ENST00000528966 REREQ9P2R6 1566 aa29.9■■■□□ 2.38
LTBP3-211ENST00000528966 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.9■■■□□ 2.38
LTBP3-211ENST00000528966 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.88■■■□□ 2.37
LTBP3-211ENST00000528966 ABCA6Q8N139 1617 aa29.87■■■□□ 2.37
LTBP3-211ENST00000528966 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
LTBP3-211ENST00000528966 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 FMN1Q68DA7 1419 aa29.81■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.81■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.8■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.8■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.8■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 AGLP35573 1532 aa29.8■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.79■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 NCOA1Q15788 1441 aa29.79■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.77■■■□□ 2.36
LTBP3-211ENST00000528966 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.75■■■□□ 2.35
LTBP3-211ENST00000528966 CLIP1P30622 1438 aa29.72■■■□□ 2.35
LTBP3-211ENST00000528966 ABCC1P33527 1531 aa29.72■■■□□ 2.35
LTBP3-211ENST00000528966 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
LTBP3-211ENST00000528966 PREX2Q70Z35 1606 aa29.71■■■□□ 2.35
LTBP3-211ENST00000528966 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.7■■■□□ 2.35
LTBP3-211ENST00000528966 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.7■■■□□ 2.35
LTBP3-211ENST00000528966 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.68■■■□□ 2.34
LTBP3-211ENST00000528966 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.68■■■□□ 2.34
LTBP3-211ENST00000528966 MROH2AA6NES4 1674 aa29.63■■■□□ 2.33
LTBP3-211ENST00000528966 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.63■■■□□ 2.33
LTBP3-211ENST00000528966 NPATQ14207 1427 aa29.62■■■□□ 2.33
LTBP3-211ENST00000528966 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
LTBP3-211ENST00000528966 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
LTBP3-211ENST00000528966 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.57■■■□□ 2.32
LTBP3-211ENST00000528966 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.57■■■□□ 2.32
LTBP3-211ENST00000528966 ZMYM3Q14202 1370 aa29.55■■■□□ 2.32
LTBP3-211ENST00000528966 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.55■■■□□ 2.32
LTBP3-211ENST00000528966 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.54■■■□□ 2.32
LTBP3-211ENST00000528966 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
LTBP3-211ENST00000528966 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.52■■■□□ 2.32
LTBP3-211ENST00000528966 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
LTBP3-211ENST00000528966 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
LTBP3-211ENST00000528966 PLA2R1Q13018 1463 aa29.49■■■□□ 2.31
LTBP3-211ENST00000528966 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
LTBP3-211ENST00000528966 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.47■■■□□ 2.31
LTBP3-211ENST00000528966 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
LTBP3-211ENST00000528966 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.45■■■□□ 2.31
LTBP3-211ENST00000528966 PKD2Q13563 968 aa29.44■■■□□ 2.3
LTBP3-211ENST00000528966 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.44■■■□□ 2.3
LTBP3-211ENST00000528966 PLXNC1O60486 1568 aa29.43■■■□□ 2.3
LTBP3-211ENST00000528966 PTPRKQ15262 1439 aa29.43■■■□□ 2.3
LTBP3-211ENST00000528966 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
LTBP3-211ENST00000528966 ATP7AQ04656 1500 aa29.4■■■□□ 2.3
LTBP3-211ENST00000528966 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
LTBP3-211ENST00000528966 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.29
LTBP3-211ENST00000528966 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
LTBP3-211ENST00000528966 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
LTBP3-211ENST00000528966 A2MP01023 1474 aa29.36■■■□□ 2.29
LTBP3-211ENST00000528966 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
LTBP3-211ENST00000528966 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.34■■■□□ 2.29
LTBP3-211ENST00000528966 HSPA1LP34931 641 aa29.31■■■□□ 2.28
LTBP3-211ENST00000528966 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.3■■■□□ 2.28
LTBP3-211ENST00000528966 GGT6Q6P531 493 aa29.3■■■□□ 2.28
LTBP3-211ENST00000528966 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
LTBP3-211ENST00000528966 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.29■■■□□ 2.28
LTBP3-211ENST00000528966 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.28■■■□□ 2.28
LTBP3-211ENST00000528966 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
LTBP3-211ENST00000528966 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.25■■■□□ 2.27
LTBP3-211ENST00000528966 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.25■■■□□ 2.27
LTBP3-211ENST00000528966 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
LTBP3-211ENST00000528966 PIP4K2BP78356 416 aa29.24■■■□□ 2.27
LTBP3-211ENST00000528966 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.24■■■□□ 2.27
LTBP3-211ENST00000528966 CPS1P31327 1500 aa29.22■■■□□ 2.27
LTBP3-211ENST00000528966 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
LTBP3-211ENST00000528966 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.19■■■□□ 2.26
LTBP3-211ENST00000528966 TOM1O60784 492 aa29.18■■■□□ 2.26
LTBP3-211ENST00000528966 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.15■■■□□ 2.26
LTBP3-211ENST00000528966 ALKQ9UM73 1620 aa29.14■■■□□ 2.26
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